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因为日本基本是一个单一民族的国家，所以日本的由来其实本质上就是日本人的由来。日本人到底是怎么来的，从哪来的，什么时间来的？这个问题其实一直是一个谜，直到非常近代的二十世纪八十年代，日本的一些学者才提出了比较被认可的假说。
日本人是一个混血民族
尽管现代日本是一个民族构成高度单一的国家，但构成日本主体的和族，却很可能不是单一族群的后代。因为根据历史记载和现代考古发现，日本进入文明社会的时间非常晚，而且其发展过程也非常特殊。
根据现代考古发现，日本列岛在大约两万年前就已经有人居住了。但也许是因为和其它民族隔绝的原因，这里的原住民文明发展水平却一直几乎陷于停滞，一直到公元前300年左右，日本本土的文明还停留在新石器时代，也就是可能还没有进入原始部落时代。
（日本绳文人制作的陶器）
但在公元300年左右，日本的文明水平突然跨越了几个等级，进入了农业社会，而且一下子会冶炼铁器了，而这种跃进在一个连续发展的文明里是不可能出现的。所以进入近代以后，几乎所有主流观点都认为日本人是日本列岛上的古民族和在公元前3世纪开始从亚洲大陆迁入日本的新来者的混血。而日本列岛上的古民族被称为绳文人，而新来者则被称为弥生人。
（日本原住民阿依努人）
而关于绳文人到底是什么人，最近这些年的研究似乎开始渐渐有了定论。在回答开头石头君提到，日本基本是一个单一民族国家，之所以说基本，是因为日本的主体民族和族大概占到了日本总人口的99%，但日本也不是没有少数民族。除了一些新移民和在殖民时代形成的少数民族之外，日本也确实有一个自古以来就居住在日本本土的少数民族，叫阿依努人。
（现代人通过考古复原的绳文人外貌）
阿依努人原本广泛居住于日本本州岛和北海道岛各地，比如对日本历史有些兴趣的朋友肯定都知道日本历史上长期掌权的幕府和大将军，而这个大将军真正的头衔其实是“征夷大将军”，这里面的要征的“夷”就是阿依努人，所以其实阿依努人在日本历史上也曾经是一个比较重要的民族。但由于阿依努族在历史上一直受到和族的打压，其生存空间被不断压缩，目前只存在于北海道岛北部的少数地区了。
而根本最近这些年的很多研究，日本本土的古民族绳文人，很可能就是阿依努人的祖先。而后来弥生人大量来到日本之后，多数绳文人被掌握先进文化的弥生人同化，和弥生人混血形成了现在的和族，而少量拒绝被同化的绳文人则保留了自己的民族性，后来演变成了阿依努人。而通过语言学研究和基因检测，目前主流观点认为绳文人可能是在大约两万年前从东南亚地区迁徙到日本列岛的。
弥生人来源之谜
但客观地说，绳文人只是日本人的血统来源之一，日本古文化起源的主要来源还是在公元前3世纪开始来到日本的弥生人。但弥生人的来源在日本就更是一个难解之谜了。目前比较确定的只有一点，即他们来自亚洲大陆。但具体是大陆上的哪里就没有定论了。
（现代复原的弥生人生活场景，现代普遍认为日本人是弥生人和绳文人的混血）
目前比较流行的观点大概有三种，即朝鲜半岛说、中国江南说和东北亚说。主张弥生人来自朝鲜半岛和中国江南的主要理由是这些地方也都种植稻米，而种植稻米正是日本进入弥生时代的一个主要标志。而东北亚说的主要理由则是考古发现古代一些弥生人的骨骼和东北亚一些民族非常类似，另外在一些日本古墓里出土的陶器和东北亚一些古墓里的陶器也比较接近。
（弥生时代，日本人突然会熟练地冶炼金属了）
另外从语言角度分析，日本是一个无法和其它语言归类的孤立语，但它在一些方面和朝鲜语以及在东北亚流行的阿尔泰语系部分语言有相似的成分，近年来还有学者通过研究说日语和古代中国北方一个叫扶余的民族语言非常接近。但这些研究还是解决不了日本的归类问题，所以日语现在还是被认为是一种孤立语，或者自成一族。但从日语和朝鲜语以及阿尔泰语言很多方面接近这一点来看，日本人的祖先很可能有这些民族的血统。
至于国内一些朋友觉得日语有些方面和汉语也接近，以此为理由说日本人是中国人后裔，其实这个是站不住脚的。日语里确实有很多词汇和汉语发音类似，但这是因为日本后来曾经长期受中国的影响，引入了大量汉语借词，并使用汉字作为书写工具，但这是日本进入文明时代之后的事，不是日本民族形成之前的事，所以这个和日本民族的起源是没有关系的。日语无论从语法还是基础词汇发音方面和汉语都完全不是一个体系，所以日语和汉语从语言学的角度看其实距离是很远的。
（日本新宫市的徐福像，传说此地是徐福在日本的登陆地）
不过刚才也说到，日本进入弥生时代是在公元前300年左右。说到这里可能很多朋友就会联想到中国历史上和这个时间很接近的一个事件了，即徐福东渡。甚至有些人认为徐福就是日本历史上最早的天皇神武天皇。对于这件事，石头君觉得确实是有可能的，在其它回答里也曾经详细说过。总而言之就是时间上和日本文明的飞跃期极其接近，而且现代关于日本弥生人的来源不排除来自中国的可能，此外无论是日本本土还是朝鲜半岛，都存在大量关于徐福东渡日本的相关传说，日本本土甚至还有徐福登陆地的具体说法，所以把日本带入文明时代的弥生人确实有可能就是徐福所带领的那个东渡船队，或者至少其中相当大一部分人是。
（描绘徐福东渡日本船只的日本浮世绘）
因此综合说来，日本和和族是东南亚古民族、中国古民族和东北亚古民族（包括朝鲜人）混血所形成的一个民族。而日本这个国家，正是由和族通过1000多年的历史进程所建立的国家。（网图侵删）
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