Jenne 自然部落 编译: 面对事实，这就是“未来奇迹”的原因。
这项最新的《古代基因组学揭示日本人口的三方起源》研究报告，提供了一个全新的日本基因组起源三方模型，颠覆了已经使用了很长时间的双血统模型。感兴趣的专业童鞋可去《科学进展》官网阅读英文原版论文或在本公号后台找小编索取PDF，本文只作为科普，参考。
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从中提取 DNA 的古代日本头骨之一。图片来源：Shigeki Nakagome / 都柏林三一学院
古代DNA改写日本祖先的故事
萨希尔·潘迪 2021 年 9 月 19 日
日本群岛自旧石器时代晚期（公元前 36,000 年）就被人类占领，直到现在，双重基因组日本血统一直是主导理论。都柏林三一学院进行的一项新研究发表在《科学进展》杂志上，彻底改变了这种说法，指出了日本三方血统，即来自三个不同的古代人群的遗传起源。
“我们对日本人口三方结构的发现感到非常兴奋。这一发现对于利用古代基因组学的力量改写现代日本人的起源具有重要意义，”三一学院的遗传学家 Shigeki Nakagome 教授说，他是都柏林三一学院和该研究的共同主要作者。
基于aDNA和新基因组样本的日本血统
从人类骨骼中提取的aDNA（古代 DNA），来自 12 个新测序的来自农业前后时期的古代日本基因组，证实了早期土著绳文狩猎采集者和移民弥生农民的遗传特征。
然而，aDNA 分析还揭示了第三个日本血统来源。这第三个遗传成分来自古坟人，这是一个在公元 3 世纪到 7 世纪之间迅速发展的日本文化阶段。
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研究中最古老的骨骼是9,000 年前的在爱媛县发现的绳文女性骨骼，从中提取了 DNA。
但最新研究的古代 DNA 分析揭示了现代基因数据完全遗漏的一些东西。日本金泽大学的遗传学家和研究共同负责人高石加仓教授表示，来自石川县古坟时代遗址的三具 1500 年前的日本骨骼显示了三个主要的遗传来源。
日本大阪府藤井寺和羽木野的一百二十三座古坟群，百花古一古坟群的鸟瞰图。墓冢三十一个是锁孔形的，三十个是圆形的，四十八个是长方形的，还有十四个形状不定的。（克劳德金/ Adobe Stock）
第三日本血统来源：古坟人
古坟时代与日本政治集权的首次出现有关，这种集权持续并最终成为主导。绳文人在 16,000 至 3,000 年前占领了日本群岛，而弥生人则从亚洲大陆（特别是东北部）迁徙而来，并在公元前 900 年至公元 300 年间居住在日本。也是弥生人将水稻种植技术引入日本。
根据研究结果，古坟 DNA 占日本血统的 71%，而绳文和弥生 DNA 分别占 13% 和 16%。
图。古代日本个体的采样位置、日期和基因组覆盖率。
（A）考古遗址标有本研究中新测序的单个基因组的圆圈和三角形（如果以前报道过）（见表 1和表 S1）。颜色代表日本史前史和原始史的三个不同时期：绳纹、弥生和古坟。（乙）每个单独的标绘与对整个基因组的覆盖X上的轴线与中位数年龄（岁本前）ÿ轴。九个绳纹个体根据年龄分为五个不同的亚时期（见注释 S1）：初期（JpKa6904）、早期（JpOd274、JpOd6、JpOd282、JpOd181 和 JpFu1）、中期（JpKo2）、晚期（JpKo13、 JpHi01、F23 和 F5) 和最终 (IK002)。
古坟时代的基因变化。
( A ) 突出显示f 4 (Mbuti, X ; Yayoi, Kofun)结果的地理地图；与弥生相比，Z值 >3.0 的大陆古代和现代人口明显更接近古坟，用红色三角形表示，而与两个种群对称相关的则用灰色圆圈表示。测试的种群根据年龄分为四个不同时期：旧石器时代上（> 16,000 年 BP）、绳纹（从 16,000 到 3000 年 BP）、绳纹后（从 3000 年 BP 到现在）和现在日。Han 在当前面板中以蓝色三角形突出显示。(乙) Kofun 个体的遗传祖先以绳文、东北亚 (WLR_BA_o 和 HMMH_MN) 和汉族的三向混合物为模型。竖线表示由 qpAdm 估计的 ±1 SE。外加剂比例值见表S10。
有趣的是，古坟的血统与占中国大部分人口的汉族的基因最为相似。“在这个时期 [Kofun] 开始使用汉字，例如刻在金属器具上的汉字，例如剑，”纳卡戈姆 说。他指的是通过朝鲜半岛从中国引进技术和文化。
“在随后的弥生时代采用水稻种植之前，土著绳文人在日本拥有自己独特的生活方式和文化数千年。我们的分析清楚地发现，他们是一个基因独特的人群，所有样本之间的亲和力异常高，三一学院 的研究员尼尔·库克解释说，即使是那些年龄相差数千年并从不同岛屿上挖掘出来的个体。“这些结果强烈表明该种群长期与大陆其他地区隔绝。”
古坟时代对陶器的显着贡献是 Sueki（或 Sue）陶器，最早生产于 5 世纪中叶。Sueki的根源虽然可以追溯到古代中国，但它的直接前身是韩国三国时期的灰器。在技术上比绳纹和弥生陶器更先进，末木标志着日本陶瓷史上的一个转折点。这张图片展示了一件古坟日本粗陶器，一个卧式瓶子，来自 6 世纪后期。（大都会艺术博物馆 / CC0）
由于海平面上升，日本与大陆隔离
仅在过去的 3000 年间，日本才发生了最激进的文化变革，从狩猎采集者的生活方式转变为水稻种植、中国文字、新型陶器和先进的政治组织。
日本与亚洲大陆其他地区的地理隔离，以及 15,000 至 20,000 年前的长期孤立，意味着日本的文化历史遵循其自身孤立的轨迹，直到大陆移民在弥生时代到来。
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这是因为海平面上升导致整体“与大陆人口的深度分化”，导致岛国化程度增加。上升的海平面一定淹没了连接日本南部群岛和亚洲大陆的陆桥。研究人员怀疑古人类是在公元前 26,000 年左右的末次盛冰期通过朝鲜半岛抵达日本。
“我们现在知道，源自觅食、农业和国家形成阶段的祖先对当今日本人口的形成做出了重大贡献。简而言之，我们拥有一个全新的日本基因组起源三方模型——而不是已经使用了很长时间的双血统模型，”中込教授总结道。
注：Nakagome实验室医学院， 都柏林三一学院。该实验室旨在了解进化压力如何影响人类种群的遗传变异，以及过去自然选择对复杂疾病易感性的影响。他们的研究利用实验和计算工具和方法，将它们整合到一种新方法中，以利用尖端的高通量测序技术获取基因组和功能图谱，并创建一个强大的框架来揭示遗传变异在人类疾病和进化中的生物学作用。
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