线粒体作为细胞内的重要细胞器，不仅负责能量的产生和代谢调节，还参与维持内环境稳定、糖原的合成以及脂肪的代谢等多种功能。然而，当线粒体功能受损或异常时，它们可能引发有害的炎症反应，进而与多种疾病的发生和发展密切相关。
线粒体的主要功能之一是氧化供能和代谢调节，它们通过氧化代谢过程产生能量，为细胞提供所需的ATP。当线粒体受损或功能障碍时，氧化应激和代谢失衡可能发生，导致细胞内环境的不稳定。这种不稳定状态可能触发炎症反应，作为机体对损伤和感染的防御反应。
线粒体还参与维持内环境的稳定，它们含有柠檬酸、苹果酸等酸性物质，有助于维持细胞的酸碱平衡。当线粒体功能异常时，这种平衡可能被打破，导致细胞内部环境的紊乱，进一步引发炎症反应。
此外，线粒体在糖原的合成和脂肪的代谢中也发挥着重要作用，当线粒体功能受损时，这些过程可能受到影响，导致能量供应不足和代谢产物的积累。这些变化可能进一步加剧炎症反应，并对细胞和组织造成损伤。
更重要的是，线粒体在炎症反应的控制和调节中扮演着关键角色，当线粒体受损或功能障碍时，它们可能释放损伤相关分子模式（DAMPs），这些分子能够激活炎症反应。通透线粒体的自噬处理是一种保护机制，旨在清除受损的线粒体并防止有害的炎症反应。然而，当这种保护机制失效或存在缺陷时，线粒体引起的炎症反应可能加剧并导致疾病的发生。
多种疾病与线粒体功能障碍和炎症反应密切相关：
例如，线粒体疾病是一类由线粒体功能异常引起的遗传性疾病，这些疾病通常伴随着炎症反应和氧化应激的增加。此外，一些慢性炎症性疾病如类风湿性关节炎、炎症性肠病等也与线粒体功能障碍有关。