俄罗斯罗曼诺夫王朝建立后，疯狂扩张，哥萨克一路东进。
公元1635年，皇太极征服了外贝加尔地区的索伦部。1636年，皇太极征服漠南蒙古，元室后裔林丹汗奉上了传国玉玺。从此，皇太极就兼任蒙古大汗。1638年，漠北喀尔喀蒙古向大清奉上了“九白之贡”，表示臣服。这也预示着，包括贝加尔湖在内的广大漠北地区，在名义归属大清王朝。
但大清对漠北的主权只停留在形式上，连羁縻统治也算不上。更为严重的是，1644年，清军大举入关，揭开了中国改朝换代的序幕。从此，满清的统治重心完全转移到关内，北方无暇他顾。这就给了俄国人南侵的绝佳时机。
早在1643年沙俄势力已抵达贝加尔湖北畔，随后沿着贝加尔湖周围，一系列要塞建立了起来。1646年，哥萨克在安加拉河口修建了上安加尔斯克。1652年，哥萨克在伊尔库特河注入安加拉河的地方，修建了冬营地，它以后变成了著名的伊尔库茨克。
1687年9月，戈洛文进入乌丁斯克城，这个地方是现在叫乌兰乌德，位于后贝加尔色楞格河谷地，此地的城防工事是哥萨克人建造的，经济基础是中俄贸易，也被喀尔喀蒙古看作是必争之地。戈洛文在乌丁斯克停留了好几个月，他不停地和喀尔喀蒙古打交道，希望喀尔喀蒙古不要站在满清一边，因为按照沙俄的情报，“车臣汗曾准备派遣二万人的部队到雅克萨、尼布楚及其他各寨堡附近，但被呼图克图禁止”。在戈洛文停留乌丁斯克城期间，喀尔喀蒙古人和沙俄军事使团冲突不断，沙俄指责蒙古人偷马，蒙古人指责沙俄使团掠夺蒙古人口，还庇护布里亚特蒙古人。在1688年的1月26日起到3月25日，沙俄的2000人使团和8000喀尔喀蒙古人展开了激战。
喀尔喀蒙古人围困了色楞格斯克（这个城市是随后满清使者下榻的地方）和乌丁斯克城，试图学习满清困死敌人，但遭到了沙俄方面的激烈抵抗，战争的结果是7个喀尔喀台吉组成的联军被迫撤退。这场战斗看起来不起眼，却是沙俄西伯利亚势力和喀尔喀蒙古人的一场准决战。因为在在17世纪80年代沙俄在西伯利亚、远东地区的总兵力不过是6000多人，沙俄以使团名义派出的部队就有近2000人，他们分别是由500名莫斯科火枪手组成的费奥多尔团、1400人的帕维尔“士兵团”和由西伯利亚各城军役人员组成的安东·别尔赫团，这些部队的素质远远超出了西伯利亚地区盲流哥萨克组成的部队。喀尔喀蒙古人集中了8000人，还派遣了“两千名铠甲骑兵、各带两匹马”，这也是“干大事”的前奏。因为当时的蒙古军铠甲数量远不如成吉思汗时代，平均40户口才有一副铠甲，喀尔喀蒙古人也是集中了大半铠甲家当进行远征。
喀尔喀蒙古人撤退的原因除了实在啃不下沙俄城防外，另一个原因就是准噶尔的葛尔丹出兵了。1688 春天噶尔丹乘着喀尔喀蒙古人出兵远征，借口土谢图汗杀了自己弟弟多尔济扎卜，越过杭爱山，直接杀向土谢图汗大本营。土谢图汗出动五千人迎战，被噶尔丹打得全军覆没，只有八人逃出生天。
此时漠西蒙古准噶尔部崛起，准噶尔台吉（首领）噶尔丹意图恢复元朝疆域，不断对其余各部发动战争。同时北面的沙俄向南扩张，对蒙古草原鲸吞蚕食。
1687年，乌丁斯克之役爆发，沙俄军队围困土谢图汗部数月，最终土谢图汗部独木难支向南败退，俄国占领了贝加尔地区。
1689年雅克萨之战后，中俄签订《尼布楚条约》，对东北地区边境进行了详细划分。但此时康熙皇帝忙于征战准噶尔部，为了使俄国保持中立，《尼布楚条约》没有确定贝加尔湖及周边乌丁斯克地区的归属，默认了俄国对这一地区的控制。
1691年草原诸部不堪沙俄与准噶尔的征讨，彻底归顺清王朝，康熙皇帝与蒙古各部王公会盟，外蒙古正式纳入中国版图，但已经不包括贝加尔湖。
1727年，清王朝改换君主。为了彻底解决准噶尔部叛乱，雍正皇帝与沙俄先后签订《布连斯奇条约》、《恰克图条约》，确定了中俄中段边界。
至此，雍正皇帝完全将贝加尔湖和乌丁斯克地区拱手让给俄国。