线粒体参与调控细胞内的炎症反应，在调控炎症的过程中扮演着重要的角色。
ROS在炎症反应中起到关键作用，它们可以激活多种信号通路，从而引发炎症反应。线粒体是ROS的主要来源之一，当线粒体功能异常时，ROS的产生可能增加，导致炎症反应的加剧。因此，线粒体通过维持ROS的平衡来调控炎症的发生和发展。
线粒体还通过参与细胞凋亡过程来调控炎症。细胞凋亡是一种程序性细胞死亡过程，它在维持组织稳态和防止炎症反应过度中起到重要作用。线粒体在细胞凋亡中发挥着核心作用，通过释放凋亡相关因子来触发凋亡过程。当线粒体功能受损时，可能导致细胞凋亡异常，进而影响炎症反应的调控。
此外，线粒体还通过参与自噬过程来调控炎症。自噬是一种细胞内的降解过程，通过清除受损或多余的细胞器和蛋白质来维持细胞的稳态。当线粒体受损或功能异常时，它们可能成为自噬的目标，通过自噬过程被降解并清除。这种线粒体自噬过程有助于减少炎症信号的释放，从而抑制炎症反应的过度发生。
线粒体还通过与其他细胞器的相互作用来调控炎症
例如，线粒体与内质网之间的接触点被称为线粒体相关内质网膜（MAM），这些接触点促进了两者之间的物质交换和信号传递。通过MAM，线粒体可以感知内质网中的应激信号，并相应地调整其功能和活性，从而调控炎症反应。