【新冠病毒】科学家揭示最持久新冠病例患病318天：体内病毒变异40次；全球新冠肺炎确诊病例超2亿例世卫组织

2021-08-06 14:56#1 标记1

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科学家揭示最持久新冠病例患病318天：体内病毒变异40次
研究发现病患感染后7个月 SARS-CoV-2抗体仍保持稳定甚至增加
全球新冠肺炎确诊病例超2亿例世卫组织：多因素“推波助澜”
斯坦福研究表明为何应接种第二剂COVID-19疫苗
研究：喝咖啡和摄入大量蔬菜可能有助于降低COVID-19感染风险

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科学家揭示最持久新冠病例患病318天：体内病毒变异40次
斯科尔科沃科学技术研究院发表在预印本服务器上的一项有关患病时间最长新冠肺炎病例的研究，揭示了变异新冠病毒逃避细胞免疫的新途径。众所周知，新冠病毒一直以来都在不断变异，这些病毒变异导致了一些传染性更强、更致命的病毒变种，就像如今在全球肆虐的德尔塔（Delta）变异毒株。

如果病毒在患者身上停留的时间足够长，那么病毒就有可能持续变异，从而逃避人体免疫系统。而这些免疫功能低下的患者，就可能成为病毒的“健身房”。
为此，斯科尔科沃科学技术研究院联合了多家科研机构，研究了一名感染新冠病毒318天的患者。该患者是一名患晚期非霍奇金弥漫性B细胞淋巴瘤的女性。
她于2020年4月首次病毒检测呈阳性，并在近一年后的2021年3月康复，病毒检测呈阴性。在整个病毒感染期间，该患者出现了两次重症，并伴有发热和肺炎等症状。
通过对该患者体内病毒进行全基因组测序发现，患者体内积累了40个突变，病毒的进化速度远超普通人。幸运的是，这些变异病毒并没有传播给其他人。
研究人员表示，由于该患者患有非霍奇金弥漫性B细胞淋巴瘤，对其治疗方案导致她外周血中没有B淋巴细胞，也几乎没有任何IgG抗体，因此她的体液免疫基本上是“无效的”。
通过进一步研究发现，在免疫力受损的患者中，T细胞逃逸是一种未被充分认识的、潜在的促进新型冠状病毒方式。
这或许有助于解释那些传播能力更强、更致命的病毒变种的起源，当它们在某些免疫受损的患者中产生突变时，通常会快速积累多个突变。而这些患者就像病毒的“健身房”，能够让病毒越发强大。
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研究发现病患感染后7个月 SARS-CoV-2抗体仍保持稳定甚至增加
根据由"la Caixa"基金会支持的巴塞罗那全球健康研究所（ISGlobal）与巴塞罗那医院诊所合作进行的一项针对医护人员队列的后续研究，针对SARS-CoV-2穗状蛋白的IgG抗体水平在感染7个月后保持稳定，甚至有所增加。发表在《自然-通讯》上的研究结果也支持这样的观点，即预先存在的针对普通感冒冠状病毒的抗体也可以保护人们免受COVID-19的伤害。

为了预测大流行病的演变并制定有效的战略，关键是要更好地了解对SARS-CoV-2的免疫力的动态和持续时间，以及针对引起普通感冒的冠状病毒的已有抗体的可能作用。考虑到这一目标，由ISGlobal研究员Carlota Dobaño领导的团队从大流行开始就对医院诊所的医护人员队列（SEROCOV研究）进行了跟踪，以评估针对不同SARS-CoV-2抗原的抗体水平。
研究小组分析了578名参与者的血样，这些血样是在2020年3月至10月的四个不同时间点采集的。他们使用Luminex技术在同一样本中测量了针对6种不同SARS-CoV-2抗原的IgA、IgM或IgG抗体的水平和类型，以及针对导致人类普通感冒的四种冠状病毒的抗体的存在。他们还与巴塞罗那大学的研究人员合作，分析了抗体的中和活性。这项研究得到了欧洲创新网络EIT Health的资助。
结果显示，医护人员中的大多数感染发生在第一波大流行期间（在2020年3月至10月期间）。除了针对核苷酸（N）的IgM和IgG抗体外，其余的IgG抗体（包括那些具有中和活性的抗体）随着时间的推移保持稳定，证实了最近其他研究的结果。
该研究的高级合著者Gemma Moncunill说："相当令人惊讶的是，我们甚至看到75%的参与者从第5个月开始IgG anti-Spike抗体的增加，而这些人群没有任何重新暴露于病毒的证据，即在该队列中没有观察到再感染。"
针对人类感冒冠状病毒（HCoV）的抗体的研究结果表明它们可以对COVID-19感染或疾病提供交叉保护。被SARS-CoV-2感染的人的HCoV抗体水平较低。此外，无症状者的抗HCoV IgG和IgA水平比有症状的感染者高。Dobaño说："尽管预先存在的对普通感冒冠状病毒的免疫力的交叉保护还有待证实，但这可能有助于解释人口中对该疾病的易感性的巨大差异。"
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全球新冠肺炎确诊病例超2亿例世卫组织：多因素“推波助澜”
根据世界卫生组织官网的统计数据，全球新冠肺炎累计确诊病例于欧洲中部夏令时间8月5日超过2亿例。世卫组织总干事谭德塞当天表示，“世界正面临真正的危险，我们已经取得的防疫成果正在被侵蚀。”

欧美地区累计确诊病例数占全球总数约七成
根据世卫组织最新实时统计数据，截至欧洲中部夏令时间8月5日18时08分（北京时间8月6日0时08分），全球累计新冠肺炎确诊病例超过2亿例，达200174883例，累计死亡病例超过425万例。

在世卫组织将全球划分出的6个区域中，疫情最严重的是美洲区域和欧洲区域。全球累计确诊病例的近四成（39%）来自美洲区域，全球累计死亡病例的近一半（48%）也来自美洲区域。而欧洲区域的累计确诊病例数和累计死亡病例数也都分别占到了全球总数的30%和29%。

从国别看，美国累计确诊病例和死亡病例数为全球最多，累计确诊超过3500万例，死亡近61万例。
自疫情暴发以来，从总体上看，全球新增新冠肺炎确诊病例数的增长速度一直在加快。全球累计确诊病例数达到1亿例用了超过1年的时间，而从1亿例到2亿例只用了约半年的时间。
谭德塞：病例数增加不仅仅是自然过程多因素“推波助澜”

世卫组织在4日发布的最新一期每周疫情报告中警告说，全球新增病例数已经连续一个多月保持增长势头。世卫组织总干事谭德塞5日在世卫组织成员国每周例行通报会上说，“现在世界正面临真正的危险，我们已经取得的防疫成果正在被侵蚀。全球报告的累计确诊病例数即将超过2亿（谭德塞发言时数据还未更新），而真实的感染数字实际上要高得多。”
谭德塞还表示，高传播性的德尔塔变异株已经至少在132个国家和地区被发现。全球病例数的增加不仅仅是一个自然过程，社会接触和流动性增加、公共卫生和防疫措施不一致以及疫苗获取不公平，都对它起到了推波助澜的作用。
世卫组织：低收入国家新冠病毒检测率过低
谭德塞5日在世卫组织成员国每周例行通报会上说，必须要扭转大多数新冠疫苗流向富裕国家的局面，低收入国家需要获得更多疫苗，以完成世卫组织制定的在9月底前，保证所有国家10%的人口都能接种疫苗。
谭德塞还警告说，“低收入国家的新冠病毒检测率还不到高收入国家的2%，这使我们对了解当地新冠疫情的趋势以及是否正在出现新的、更危险的变种一无所知。”
谭德塞表示，疫苗不是唯一的工具，只靠疫苗无法打败新冠肺炎大流行，我们需要更全面的方法，将疫苗与已知的、行之有效的公共卫生和社会措施结合起来。
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斯坦福研究表明为何应接种第二剂COVID-19疫苗
根据斯坦福大学医学院研究人员领导的一项研究，COVID-19疫苗的第二剂诱发了对免疫系统中提供广泛抗病毒保护的一个部分的有力促进。这一发现强烈支持应接种第二剂疫苗的观点。

病理学、微生物学和免疫学教授Bali Pulendran博士说：“尽管RNA疫苗的有效性突出，但人们对RNA疫苗究竟是如何工作的知之甚少。因此，我们对其中一种疫苗诱发的免疫反应进行了细致的探究。”
这项研究于7月12日发表在《自然》杂志上，旨在找出由辉瑞公司销售的疫苗对免疫反应的众多组成部分到底有什么影响。
研究人员分析了疫苗接种者的血液样本。他们计算了抗体，测量了免疫信号蛋白的水平，并对242479个独立的免疫细胞的类型和状态的基因组中的每一个基因的表达进行了描述。
Pulendran说：“全世界的注意力最近都集中在COVID-19疫苗上，特别是新型RNA疫苗。”

他与纳迪西基金会儿科食品、过敏、免疫和哮喘教授、儿科教授Kari Nadeau博士，以及生物医学信息学和生物医学数据科学副教授Purvesh Khatri博士共同担任该研究的高级作者。该研究的主要作者是Pulendran实验室的高级研究科学家Prabhu Arunachalam博士；Khatri实验室的前研究生、医学生Madeleine Scott博士；以及Pulendran斯坦福实验室的前博士后学者、现在亚特兰大Yerkes国家灵长类研究中心的副教授Thomas Hagan博士。
未涉足的领域
Pulendran说：“这是第一次向人类提供RNA疫苗，我们不知道它们是如何做到的：对COVID-19提供95%的保护。”
传统上，批准新疫苗的主要免疫学依据是其诱导中和抗体的能力：由称为B细胞的免疫细胞创造的个性化蛋白质，能够粘附在病毒上并阻止其感染细胞。Pulendran表示：“抗体很容易测量。但免疫系统要比这复杂得多。单纯的抗体并不能完全反映其复杂性和潜在的保护范围。”
Pulendran和他的同事们评估了受疫苗影响的所有免疫细胞类型的运作情况：它们的数量、它们的激活水平、它们表达的基因以及它们在接种后制造和分泌的蛋白质和代谢物。
Pulendran和他的同事们研究的一个关键免疫系统成分是T细胞：这些搜索和破坏性的免疫细胞不像抗体那样附着在病毒颗粒上，而是在身体组织中探测带有病毒感染迹象的细胞。一旦发现，它们就会将这些细胞撕碎。
此外，先天免疫系统，即各种第一反应细胞，现在被理解为具有极大的重要性。Pulendran称，这是身体的第六感，其组成细胞最先意识到病原体的存在。尽管它们不善于区分不同的病原体，但它们会分泌 “发令枪”信号蛋白，启动适应性免疫系统的反应--攻击特定病毒或细菌种类或菌株的B和T细胞。在适应性免疫系统启动所需的一周左右时间里，先天性免疫细胞执行关键任务，通过吞噬或发射有毒物质（尽管有点不分青红皂白）来阻止初起的感染。

一种不同类型的疫苗
辉瑞公司的疫苗与Moderna公司的疫苗一样，与由活的或死的病原体、单个蛋白质或碳水化合物组成的经典疫苗的工作方式截然不同，后者能“训练”免疫系统锁定特定的微生物并将其消灭掉。辉瑞公司和Moderna公司的疫苗反而包含了制造SARS-CoV-2（导致COVID-19的病毒）用来锁定它所感染的细胞的刺突糖蛋白的基因配方。
2020年12月，斯坦福医学院开始为人们接种辉瑞公司的疫苗。这刺激了Pulendran的愿望，即收集一份关于对其免疫反应的完整报告单。
研究小组选择了56名健康志愿者，并在第一剂和第二剂之前和之后的多个时间点提取了他们的血液样本。研究人员发现，第一剂增加了SARS-CoV-2的特异性抗体水平，正如预期的那样，但并不像第二剂那样多。
Pulendran说：“第二剂具有强大的有益作用，远远超过第一针的作用。它刺激了抗体水平的成倍增长，出现了仅接种第一剂后没有的可怕的T细胞反应，以及惊人地增强了先天免疫反应"。”
Pulendran说，出乎意料的是，该疫苗--尤其是第二剂--引起了新发现的第一反应细胞群的大规模“动员”，这些细胞通常是稀少和静止的。

在Pulendran领导的最近一项疫苗研究中首次发现，这些细胞（通常丰富的细胞的一个小分支，称为单核细胞）表达高水平的抗病毒基因--在应对实际的COVID-19感染时几乎不动。但辉瑞公司的疫苗诱导了它们。
这个特殊的单核细胞群体在接种疫苗之前只占所有循环血细胞的0.01%。但在接种第二剂辉瑞疫苗后，它们的数量扩大了100倍，占到所有血细胞的整整1%。此外，它们的抗病毒性更强。Pulendran说，它们似乎具有独特的能力，能够对各种病毒感染提供广泛保护。
Pulendran说：“在加强免疫后仅一天，这些细胞的频率就异常增加，令人惊讶。这些细胞有可能不仅能够对抗 SARS-CoV-2，还能对抗其他病毒。”
https://www.nature.com/articles/s41586-021-03791-x
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研究：喝咖啡和摄入大量蔬菜可能有助于降低COVID-19感染风险
美国西北大学的一项新研究显示，喝咖啡和摄入大量蔬菜可能对预防COVID-19感染提供一些保护。研究作者认为这是第一个使用人口数据研究特定饮食摄入在预防COVID-19中的作用的研究。

“一个人的营养会影响免疫力，”研究高级作者、西北大学范伯格医学院预防医学副教授Marilyn Cornelis说。“而免疫系统在个人对传染病（包括COVID-19）的易感性和反应中发挥着关键作用。”该研究发现，母乳喂养以及少吃加工肉类也可能提供保护。
“除了遵循目前的指导方针来减缓病毒的传播，我们还为其他相对简单的方法提供支持，个人可以通过这些方法来减少他们的风险，那就是通过饮食和营养，”Cornelis说。
这篇关于营养和COVID-19保护的论文最近发表在《Nutrients》杂志上。
研究发现，与每天饮用少于一杯的咖啡相比，每天喝一杯或更多的咖啡与COVID-19的风险减少约10%有关。每天至少食用0.67份蔬菜（熟的或生的，不包括土豆）与感染COVID-19的风险降低有关。每天食用少至0.43份的加工肉类与COVID-19的高风险有关。与没有接受过母乳喂养的儿童相比，婴儿时期接受过母乳喂养的儿童的感染风险降低了10%。

虽然该研究显示饮食似乎可以适度降低疾病风险，但美国疾病控制与预防中心（CDC）建议将疫苗作为预防COVID-19疾病的最有效方式。COVID-19疫苗还可以减少人们传播导致COVID-19的病毒的风险。
到目前为止，大多数COVID-19的研究都集中在COVID-19测试阳性后评估的个人因素上。免疫系统受到抑制的人，如老年人和那些已有基础病的人，包括心血管疾病、高血压、糖尿病和肥胖症，更有可能经历COVID-19的严重后果。
研究饮食和营养如何促成慢性疾病的Cornelis说，除了体重管理之外，人们较少关注COVID-19感染前的其他可改变的风险因素。
该研究的第一作者、西北大学医学研究副教授Thanh-Huyen Vu博士现在正在领导分析工作，以确定这些保护性的饮食行为是专门针对COVID-19还是更广泛的呼吸道感染。将这些饮食因素与COVID-19联系起来的确切机制尚不清楚。
Cornelis说：“咖啡是咖啡因的一个主要来源，但也有几十种其他化合物可能是我们观察到的保护性关联的基础。与加工肉类的关联，但不是红肉，指向非肉类因素。”
利用英国生物库的数据，研究人员考察了2006-2010年测量的饮食行为与2020年3月至12月COVID-19感染之间的关联，当时疫苗还没有上市。他们关注的是：1）有数据可查且以前根据人类和动物研究牵涉到免疫的饮食因素；2）自我报告的咖啡、茶、蔬菜、水果、鱼肉、加工肉和红肉的摄入量。
在37988名接受COVID-19检测并被纳入研究的参与者中，17%的人检测呈阳性。
Cornelis说，英国生物库研究的观察性质限制了可以测试保护机制的程度。然而，她的许多营养研究都使用了遗传学，而且目前所有的英国生物库参与者都进行了基因分型，她希望利用这些信息来更好地了解饮食和营养如何提供对疾病的保护。