经济体制改革全面铺开之后，中国迅速发展起来，由贫穷走向富裕。在此期间，一些干部生出了堕怠之心，胆大包天居然敢搞贪腐，把整个政坛搞得乌烟瘴气，朱镕基总理对此很是厌恶，遂决定搞一次反腐行动，肃清体制内的风气，把“蛀虫”赶出革命队伍。
朱总理最早开始与贪腐势力斗争，是在上海当市长的时候，他上任的第一件事就是带人去税务、财政部门查账本，每一笔明细都要仔细核对，结果发现了不少纰漏，有好几笔款项都不知去向，明显是有人借着职务之便搞侵占，损公肥私！朱总理当即将纪检监察部门的工作人员叫过来，现场查案、办案，没过多久就揪出了害群之马。
经此一战，总理的名声传遍整个上海滩，老百姓都称赞他是“包青天”，铁面无私惩贪官，而沪地的其他官员则为之震颤，往后再也不敢胡来，严守纪律办实事，一心一意谋发展。除此之外，总理还对相关招商条例进行了修改，适当放宽了投资环境，以吸引更多的外资到上海来，活跃十里洋场的经济。
主政国务院之后，朱总理曾多次下到基层去考察，走过了大大小小数十个市、县，还去过一些极度欠发达的村庄，与老百姓面对面交流，听取群众的意见。在此期间，总理发现中层干部中有一些人心术不正，大搞权钱交易，严重损害了国家和人民群众的利益。比如在1998年，南方爆发洪灾的时候，总理亲临一线指挥赈灾，慰问灾民。
后来在视察防洪堤的时候，总理一眼就看出其是豆腐渣工程，质量远远不达标，想必这次洪灾也与此有莫大的关联。朱总理为此很是生气，他当即表示，自己一定会严查此事，给大家一个交代。没过多久，朱总理责成了一个专案组查察此事，并以此为契机，展开了一场旷日持久的大整肃，誓要将贪官全部消灭干净。
江总书记对此表示大力支持，总书记让朱总理放心大胆的去干事，无需在意任何质疑，党就是他最坚强的后盾！朱总理为表示与贪腐斗争的决心，在一次公开会议上直言自己准备了100具棺材，有99具是给贪官准备的，另外1具是给自己准备的。往后数年间，纪委以及其他监察部门累计破获贪污案数千起，处置犯罪嫌疑人逾万人。
其中最令人惊心动魄的当属1999年的特大走私案，一个跑海运的香港人，先后与内地多名干部勾结，频繁运送违禁品进入大陆，赚取了天价的利润。此案浮出水面后，一时震惊了国务院，朱总理气得直拍桌子，表示底下的人太“无法无天”了，为了挣钱什么事都干得出来。他立即让中纪委与公安部、检察院的专家去事发地福建查察此案，务必要将所有涉案人员一网打尽，以儆效尤。
由于这起案件牵涉颇广，因此无法在短时间内有个定论，一直到2001年才结案，有600余名干部被问责判刑，其中14人因为影响过于恶劣，被判死刑。值得一提的是，在办案途中，有记者询问朱总理是否遇到了阻力，无法再追查下去，总理直言没有任何阻力，党内绝对不允许贪腐发生，谁要是胆敢胡来，必定会受到惩罚。
2001年，在一次例行新闻发布会上，有人问总理中国的偷税漏税问题是否很严重。总理没有任何遮掩，大方承认税务上存在比较大的问题急需解决，总理认为，从长远来看，税务系统的发展必然是走向规范化的，监督部门往后会更加关注税务这一板块，偷税漏税未来一定会走向消亡。总理还讲到，中国目前的税收是逐年增长的，这也从侧面说明，国家对偷税漏税的打击是卓有成效的。
朱总理退休后，国务院新一届的领导人继承了他的反贪思路，持续推进廉政建设，出拳打击贪腐分子。十八大之后，反贪达到了一个新的高峰，许多省部级干部纷纷被铁拳打落马下，成为法制教育的反面案例。时至今日，针对贪腐的纠察行动还在继续，几乎每年都会有新的“老虎”被打掉，其中不乏一些有能力，却因为贪图享乐一时误入歧途的干部。