我也是百思不得其解。也查过不少关于这方面的资料。奇怪的是，即使如此，清王朝也没有立即对阿古柏政权采取军事行动。一直到了1876年6月，在失去了对新疆的控制下，整整12年之后，清王朝才发动了收复失地的战争。当时清王朝到底在干吗？曾经在清王朝统治下的新疆，事实上是一个在英俄两大国之间起着缓冲作用的地带，阿古柏能统治维吾尔人长达十年之久，主要是依赖于他的伊斯兰教政策：阿古柏试图通过伊斯兰教来让维吾尔人对自己的认可，他确实是一个虔诚的穆斯林，经常向伊斯兰教学校的学生和教职人员捐赠金钱和衣物，在攻打各地时，也绝不会忘记参拜当地的麻札，还在各地设立了伊斯兰宗教法庭，这样就提高了伊斯兰学者和教职人员的社会地位。阿古柏的这些做法换来了，维吾尔社会对伊斯兰学者和教职人员的合作。
阿古柏成立给沙皇俄国和英国势力渗透到新疆地区，提供了可乘之机。于是沙俄和英国都希望利用这个机会将新疆划入自己的势力范围。
那么问题来了，为什么清王朝反应这么慢？难道不应该等阿古柏羽翼还没丰满的时候，就应该采取军事行动做出收复的努力吗？这一切说明了清王朝在意的并不是对新疆的统治权问题，而是英俄势力与阿古柏合作，可能给整个清王朝的统治体制带来了影响和冲击。这一点左宗棠在奏书上已经说得很明白了。