中疾控刚发表的信息里谈到：“5. 奥密克戎变异株对我国现使用的核酸检测试剂是否有影响对奥密克戎变异株的基因组分析显示，其突变位点不影响我国主流核酸检测试剂的敏感性和特异性。奥密克戎变异株突变的位点主要集中在S蛋白基因的高变异区，并不位于我国第八版《新型冠状病毒肺炎防控方案》公布的核酸检测试剂引物和探针靶标区域（中国疾控中心病毒病所向全球公布的ORF1ab基因和N基因）。但南非多个实验室的数据提示，对于检测靶标为S基因的核酸检测试剂可能无法有效检出奥密克戎变异株的S基因。”
这段话容易造成误解，给读者的印象是南非的测试不太好、或会漏测奥密克戎变异株。但是南非的测试并不只测这一个基因，核酸检测几乎都是测多个基因，南非用的是常见的TaqPath这类多位点检测，用south Africa TaqPath这几个词可以查到不少报道。这个TaqPath新冠测试（又叫 S脱落测试）针对三个位点，比病毒所的检测多一个位点：- ORF1ab基因- N基因- S基因当有阿尔法和奥密克戎突变时，S基因测不到，但另外两个位点不变。所以这种核酸测试比一般测试有优势：1，可以测出新冠阳性，2，还可以作为一个代言人，快速显示病人是否可能带的是奥密克戎突变株，再由基因测序来核实。突变是可能影响测试效果的，FDA2021年9月23日的一封文件专门谈了“新冠病毒突变：对测试的影响”，文件对现有的几种核酸测试都做了分析，其中对TaqPath的最新评估是：- 由于该检测是为检测多个基因目标而设计的，因此整体的检测灵敏度应该不会受到影响。当有某些突变存在时，可能有助于早期识别患者的新变体，以减少感染的进一步扩散。世界卫生组织最近对奥密克戎的声明也提到这种测试的优越性：- 这种广泛使用的（S基因脱落）检测可以先作为该突变株的标记，以后再测序确认（见O网页链接）。其实，因为Omicron带了50多个突变，影响新冠病毒的很多部位，可能各种测试的有效性都需要核实。同时，“S基因脱落”测试到底多准确地代表了奥密克戎突变株，也值得进一步研究。所以，南非用的测试法，并不会漏测阳性病例，反而会更快地发现奥密克戎突变病例。