这个表述有问题吧。
分公司可以分为独立和非独立核算两种。非独立核算就是没有自己的账套，分公司就是花钱报费用，账在总公司那边，收入支出都是上边记。所以不存在分配利润的问题。
如果是独立核算呢，从报表角度也不会涉及分配利润的问题。分公司不是独立法人，资产所有权和法律义务都在总公司，理论上分公司的钱就是总公司的钱。
因为是分公司，没有自己的所有者权益项目，什么注册资本、资本公积、未分配利润统统没有。平时记账主要往来和收支类科目，也会有少量固定资产。到了月底可以做一份简单的会计报表，往上一报，总公司根据报表做一个汇总，收入成本费用自然汇到总部报表反映，跟着利润也并入到总部报表。利润都在大表里了，还怎么分配，自己分配给自己吗？
具体到账务，分公司花钱赚钱分钱怎么处理，就要看你采取那种处理模式。
一、收支两条线模式（非独立核算）
这种管的最严，发票上的银行账户是总公司的，客户转账也直接转到总公司。分公司要用钱通过预算申请，临时用钱特事特办，分公司可支配的现金很少，账上几乎没有余额。以前互联网不发达，分公司还是有账户的，平时也有收入打到账上，月底汇总划走。现在互联网支付发达，报账手机就可以申请，领导线上审批，当天可以到账，分公司甚至可以做到没有独立账户了。
二、子公司管理模式（独立核算）
这种分公司独立性比较强，比如现金收入比较多，客户比较信任分公司，又或者分公司领导可能有分红权等等，总之母公司对分公司管理比较弱，除了名义上是分公司，其他和子公司管理没有区别。
题主说的可能就是第二种——分公司有独立的账户，平时并表并数字，钱是不会并的。钱在分公司账户上，总公司以分红为由把钱划走了，大概就是这么回事。
账务处理嘛，分公司这边：
借：利润分配--未分配利润 贷：其他应付款-上缴总公司利润；支付时账务处理，借：其他应付款-上缴总公司利润 贷：银行存款
母公司这边反过来来一遍：
借：其他应收款—分公司上缴利润 贷：利润分配--未分配利润；收到时，借：银行存款 贷：其他应收款—分公司上缴利润
最后报表汇总时，借贷两边的利润分配会自动抵扣，绕了这么一大圈，就是A账户（分公司）的钱转到了B账户（总公司）。
要我说根本没必要这么麻烦，直接把分公司的账户与总公司的账户做一个关联，通过银行设定每月或每日或实时自动归集到总账户，分公司要用钱可以通过资金系统线上申请，这样即加强了对分公司的管控，又提高了资金使用效率，简化了账务处理，一举三得！
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