▼
研究:高传染性新冠病毒变种在被发现之前就已在全球传播数月
孕妇也能打疫苗 西班牙诞生世界首个带有新冠病毒抗体的婴儿
CDC报告:COVID-19是2020年美国第三大致死原因
美FDA授权多种非处方COVID-19检测用于常规筛查
IRVANA:可诊断COVID-19并追踪变种的快速/便携的新检测方法
关注视频号,发现更多精彩
01
研究:高传染性新冠病毒变种在被发现之前就已在全球传播数月
根据德克萨斯大学奥斯汀分校COVID-19 Modeling Consortium(新冠建模联盟)研究人员的一项新研究,在2020年10月,一种高传染性SARS-CoV-2变种已经在美国不知不觉地传播了数月时间。科学家们于12月初在英国首次发现了这种病毒,这种高传染性和更具致命性的变异病毒被认为起源于英国。
最新的研究指出,实际上在科学家发现新冠病毒变种B117 (501Y)的时候,它已经在全球蔓延了数月之久。
德克萨斯大学奥斯汀分校COVID-19建模联盟主任、综合生物学Lauren Ancel Meyers指出:“到我们去年12月得知英国的这种变异时,它已经在无声地在全球蔓延。我们估计B117型可能在2020年10月之前就已经到达美国,然而我们在两个月后才知道它的存在。”
研究人员通过对来自15个国家的数据的分析估算出英国游客在2020年9月22日至12月7日期间将这种变体带到15个国家的几率。他们发现,到11月中旬,几乎可以肯定,这种病毒变种已经在所有15个国家出现。在美国,变种可能在10月中旬就已经到达。
“这项研究突出了实验室监测的重要性,”Meyers说道,“对病毒样本进行快速和广泛的测序对于早期发现和跟踪所关注的新变种至关重要。”
UT COVID-19 Modeling Consortium成员在发表论文的同时还开发了一种新的工具以供美国各地的决策者在计划基因测序时使用从而帮助检测变异的存在。为了帮助美国扩大对变种病毒的全国性监测,新的在线计算器指出了必须进行测序的病毒样本的数量以便在新变种病毒首次出现时检测到它们。比如如果目标是在每1000例新COVID-19感染病例中有1例出现变异时检测到该变异,那么则需要每周对约3000例SARS-CoV-2阳性标本进行测序。
“卫生官员正在寻找更好的方法来管理这种病毒及其未来变种的不可预测性,”UT COVID-19 Modeling Consortium博士后研究员Spencer Woody表示,“我们的新计算器确定了必须对多少SARS-CoV-2阳性标本进行测序以确保新威胁一旦开始传播就能被识别出来。”
另外他还称,这款计算器还有另一个功能--“考虑到实验室目前的测序能力,它还能帮助实验室确定他们能多快检测到新的变异。”
Meyers说道:“我们创建这个工具是为了支持(美)联邦、州和地方卫生官员建立可靠的早期预警系统以应对这次和未来的大流行威胁。”
02
孕妇也能打疫苗 西班牙诞生世界首个带有新冠病毒抗体的婴儿
目前全球多个国家都在加速推进新冠疫苗接种,重点是18岁以上人群。孕妇能不能打疫苗有多种说法,不过打了也确实有好处,西班牙就诞生世界首个带有新冠病毒抗体的婴儿。央视新闻称,根据西班牙媒体在当地时间4月1日的报道,世界上首个带有新冠病毒抗体的婴儿在西班牙出生。
这位名叫布鲁诺的婴儿出生于伊比萨岛,他的母亲在怀孕的第三个月接种了新冠疫苗。
血液检查结果显示,母亲血液中的抗体值约为8000,婴儿的抗体值约为5000。
已发表的相关科学文献表明,妇女在怀孕期间接种的新冠疫苗可能对胎儿同样产生免疫能力,而布鲁诺的案例证明了这一点。
此前世卫组织不建议孕妇接种疫苗,除非接种疫苗的益处超出可能存在的风险,如该名孕妇是医务工作者、病毒暴露风险较高,或是存在基础疾病,感染后出现重症的风险较高等。
03
CDC报告:COVID-19是2020年美国第三大致死原因
美国疾病控制和预防中心(CDC)近日公布了去年美国民众主要死亡原因的临时死亡数据。CDC表示,COVID-19是2020年美国第三大致死原因,仅次于心脏病和癌症。2020年,COVID-19大流行在美国造成约37.5万人死亡。
CDC指出,目前,其年度死亡率统计可能仍不完整,最终报告要到年底才会到来。该机构解释说,原因是CDC的国家生命统计系统使用的是死亡证明的数据。
CDC表示,该机构需要时间来“调查某些死亡原因和处理和审查数据”。由于这个原因,目前的报告可能低估了去年发生的死亡人数及其原因。尽管如此,目前现有的数据显示COVID-19是去年美国第三大致死原因,去年新冠病毒感染是377883例死亡的主要或次要原因,占死亡总数3358814例的11.3%。
报告显示,经年龄调整后,去年的死亡率增加了15.9%。非西班牙裔美国印第安人和阿拉斯加原住民人口以及非西班牙裔黑人群体的死亡率最高。具体到COVID-19来看,西班牙裔的死亡率最高。
此外,COVID-19的死亡尤其影响到男性和85岁及以上的成年人。统计数字包括COVID-19被列为死亡原因或促成死亡的原因的死亡。
04
美FDA授权多种非处方COVID-19检测用于常规筛查
美国食品和药物管理局(FDA)已授权多种非处方(OTC)COVID-19检测,使无症状的人能够进行新冠常规筛查。此次授权涵盖了多个种类的雅培BinaxNOW,以及Quidel QuickVue At-Home OTC COVID-19检测和BD Veritor系统快速检测SARS-CoV-2。
虽然目前COVID-19检测已经越来越多,但对于需要常规筛查的人来说,仍然很棘手。在美国,这通常需要预约,并且需要前往检测中心,如当地药店。非处方检测将改变这种情况。
这些新授权的非处方COVID-19检测可用于系列筛查--FDA对无症状个体的常规检测的术语。其中一个检测也已被授权用于在医疗点设施中使用。
在一份关于新授权的声明中,FDA设备和放射健康中心主任Jeff Shuren表示:
筛查检测,尤其是今天授权的非处方检测,是国家大流行病反应的重要组成部分,许多学校、工作场所、社区和其他实体正在建立检测程序,以快速筛查COVID-19。随着FDA对多项检测的授权,公众可以放心,这些检测已经达到了我们的科学标准,获得了紧急使用授权。正如我们一直说的,如果是好的检测,我们就会授权。
这些检测可以在各种情况下使用,例如在学校和企业,可能需要确定某人是否被感染。该机构指出,它之前已经授权了其中的一些检测,但这次新的授权涵盖了无症状者的系列检测。
05
IRVANA:可诊断COVID-19并追踪变种的快速/便携的新检测方法
使用新冠病毒筛查检测的临床医生不仅可以用一种便携式设备在几分钟内诊断出COVID-19,还可以同时检测其他病毒,如流感--这可能被误认为是新冠病毒。同时,他们还可以对病毒进行测序,为COVID-19突变和变异的传播提供有价值的信息。2021年3月31日,一个由多个机构的科学家组成的研究团队在《医学》杂志上在线描述了这种被称为NIRVANA的新检测。
“这是一种病毒检测和监测方法,不需要像其他方法那样使用昂贵的基础设施,”研究共同通讯作者、Salk基因表达实验室教授Juan Carlos Izpisua Belmonte说。“我们可以用一个便携式检测来完成别人用两三个不同的检测方法、用不同的机器来做的同样的事情。”
在世界各地,已经有超过1亿人感染了SARS-CoV-2,即导致COVID-19的病毒。迄今为止,已有超50万美国人死于COVID-19,数量惊人。对人群进行检测是阻止病毒传播的关键。此外,跟踪新的SARS-CoV-2变异体的传播至关重要--其中一些变异体可能对治疗或疫苗有不同的反应。
目前确定鼻拭子是否对COVID-19呈阳性的标准方法是进行聚合酶链式反应(PCR)检测,以检测SARS-CoV-2病毒的遗传物质。然而,如果样本是阴性的,患者和临床医生就得不到任何可能导致新冠病毒样症状的信息--除非他们使用不同的拭子样本,对其他病毒进行单独的PCR检测。而如果样本对SARS-CoV-2呈阳性,他们也无法得知患者感染了哪种COVID-19变种,除非运行另一组测试;这些测试需要一台大型且昂贵的下一代基因测序机。
去年夏天,沙特阿卜杜拉国王科技大学生物科学副教授李默正在思考如何将他在基因工程和纳米孔测序方面的专业知识用于对抗COVID-19大流行。李默此前在Izpisua Belmonte实验室担任了6年的Salk博士后研究员,他想知道一种名为等温重组酶聚合酶扩增(RPA)的基因检测方法与实时纳米孔测序相结合,是否会比目前的COVID-19检测方法更有用,而且更快、更便宜、更便携。他与Izpisua Belmonte合作来寻找答案。
与PCR不同的是,PCR通过较低和较高的温度循环来分离DNA链并复制它们,RPA使用蛋白质在短短20分钟内完成同样的事情,而不是温度变化。该技术让研究人员可以复制更长的DNA片段,并同时探测多个基因。
“我们很快意识到,我们不仅可以利用这种技术来检测SARS-CoV-2,还可以同时检测其他病毒,”李默说。
在新论文中,李默和Izpisua Belmonte描述了一种小型的便携式设备,它可以使用RPA检测法同时筛选96个样本。他们将该方法称为NIRVANA,用于“等温快速病毒扩增的纳米孔测序,用于近实时分析”。
科学家们设计的NIRVANA可以同时检测COVID-19、A型流感、人体腺病毒和非SARS-CoV-2冠状病毒的样本。研究人员报告说,在短短15分钟内,设备就开始报告阳性和阴性结果。而在三个小时内,该设备就会最终确定所有96个样本的结果--包括SARS-CoV-2的五个区域的序列,这些区域特别容易积累突变,导致新的变异,比如英国发现的B.1.1.7变异。
李默和Izpisua Belmonte对10个已知SARS-CoV-2阳性的样本、60个未知SARS-CoV-2状态的样本以及藏有SARS-COV-2病毒的城市废水样本等进行了NIRVANA检测。在所有情况下,该检测都能正确识别出哪些病毒存在。测序数据还使他们能够缩小阳性样品中SARS-CoV-2的来源范围;例如区分来自中国和欧洲的菌株。
“这种检测的设计真的很灵活,所以它不仅仅局限于我们展示的例子,”李默说。“我们可以很容易地调整它来处理另一种病原体,甚至是一些新出现的东西。”
https://www.cell.com/med/pdf/S2666-6340(21)00117-3.pdf?_returnURL=https%3A%2F%2Flinkinghub.elsevier.com%2Fretrieve%2Fpii%2FS2666634021001173%3Fshowall%3Dtrue
扫二维码关注视频号,发现更多精彩视频
Science科学
了解未知 开启认知
按此关注中文公众号
Science科学英语平台
THE SCIENCE OF EVERYTHING
按此关注英文公众号
TechEdge
科技 点亮未来
按此关注中文公众号
◢ 豁然开朗请打赏 ◣
分享“票圈”,逢考必过,点亮“在看”SCI录用率提高18%