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研究：出现突破性感染的完全接种新冠疫苗的癌症患者的死亡率为13%
研究：完全接种疫苗的人仍有感染奥密克戎变体的风险
研究发现新冠病毒会影响精子质量：三个月后恢复正常
研究表明Omicron冠状病毒变种感染病例住院治疗比例相对较低
科学家在俄亥俄州6个地点的野鹿中检测到活跃的新冠感染 至少有三种变体
美国食品和药物管理局批准了第二种COVID-19抗病毒药物
美国大学模型预测：全美未来两月或激增1.4亿确诊
首例感染新冠致肺功能衰竭后进行的双肺移植手术细节公开
麻省理工提出量子新冠传感器概念 可提供更快更准确的检测结果
研究：类风湿性关节炎药物可更有效地治疗新冠肺炎住院患者
英国研究发现奥密克戎变体传播速度快 “没有证据”表明它比德尔塔更温和
COVID-19变体并不是NIH科学家们敦促追求通用冠状病毒疫苗的唯一原因
复制RNA比复制DNA更容易出错：对付新冠或需要“泛冠状病毒疫苗”
研究：mRNA疫苗在预防新冠死亡方面非常有效 但预防感染效果不佳
研究：预防未来的大流行病要先认识到人畜共患疾病的巨大威胁
研究：COVID-19不同症状的出现顺序取决于变异体
世卫：2022年必须终止新冠大流行 美国首现奥密克戎变异株死亡病例
新研究：突破性感染产生对COVID-19的“超级免疫力”
美专家分享对COVID-19新变体奥密克戎的看法
研究提供了接种mRNA新冠疫苗后心脏炎症风险的更令人放心的数据
研究：动物体内的病毒进化或能揭示COVID-19的未来
CDC的失败：调查发现第首批COVID-19试验中存在设计错误和样本污染问题
Novavax COVID-19疫苗在试验中被认为"高度有效且非常安全"
科学家发现新冠疫情新特点：近一半新冠病毒感染者没有症状
生物学家：COVID-19将会发展成地方病
新研究发现Moderna疫苗对所有SARS-CoV-2病毒变种"高度有效"
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研究：出现突破性感染的完全接种新冠疫苗的癌症患者的死亡率为13%
第一项评估完全接种疫苗的癌症患者突破性感染COVID-19的临床特征和结果的研究表明，他们仍然有住院和死亡的高风险。12月24日发表在《肿瘤学年鉴》上的这项研究表明，出现突破性感染的完全接种疫苗的癌症患者的住院率为65%，ICU或机械通气率为19%，死亡率为13%。
这项研究是由COVID-19和癌症联盟（CCC19）进行的，该联盟由129个研究中心组成，自新冠大流行开始以来一直在跟踪COVID-19对癌症患者的影响。
达纳-法伯癌症研究所Lank泌尿生殖系统护理中心主任、该报告的资深作者Toni Choueiri博士说：“即使在完全接种疫苗之后，突破性感染COVID-19的癌症患者仍然可能经历严重的后果，包括死亡。这就是为什么多层次的方法，包括戴口罩和保持社交距离，以及疫苗接种加COVID-19的加强针，在可预见的未来仍然是一个重要的方法。”
患者在接种了两剂辉瑞-BioNTech或Moderna疫苗，或一剂强生疫苗后，被认为是完全接种了疫苗，最后一剂疫苗是在突破性感染COVID-19之前的足够长的时间内，认为他们完全接种了疫苗。这些数据是在2020年11月1日至2021年5月31日期间收集的，当时美国疾病控制与预防中心（CDC）还没有向癌症患者推荐加强针疫苗。
“由于在临床护理中没有常规收集免疫力的措施，我们不知道这些是在接种疫苗后产生有效免疫反应的患者；很多新出现的数据表明，癌症患者，特别是血癌患者，没有产生足够的保护性抗体反应。”CCC19研究协调中心主任、范德比尔特-英格拉姆癌症中心副教授、该研究的资深作者Jeremy Warner博士说：“重要的是要注意，我们在提供疫苗接种前发现的许多相同因素--年龄、合并症、表现状态和正在进展的癌症--似乎仍然在推动许多不良结果。”
该联盟为研究确定了1787名癌症和COVID-19患者，其中绝大多数人都没有接种疫苗。完全接种的人数为54人，46%的完全接种者的淋巴细胞水平下降--负责对病毒进行免疫反应的T细胞和B细胞。淋巴细胞减少症通常发生在接受抗CD20单克隆抗体或CAR-T细胞治疗血液学恶性肿瘤（包括淋巴瘤和白血病）的癌症患者身上。该研究似乎支持以前的观察，即血液系统恶性肿瘤患者因COVID-19而出现严重后果的风险更大。然而，研究人员指出，该研究中的病人数量太少，无法对可能与突破性感染有关的特定类型的抗癌疗法做出明确的结论。接受皮质类固醇治疗方案的患者似乎也更容易住院。
“在利用额外的疫苗剂量之前，其他免疫力低下的病人群体，如器官移植受者，也有类似的结果（完全接种疫苗的人死亡率高）。这些发现是在人们担心免疫逃逸突变体（例如奥密克戎）可能来自免疫系统较弱的慢性感染患者的时候出现的。因此，免疫抑制者及其密切接触者应该是治疗和预防干预的目标群体，包括社区一级的宣传和教育工作，”布朗大学沃伦·阿尔伯特医学院的传染病临床医生、该研究的资深作者Dimitrios Farmakiotis说。
https://www.annalsofoncology.org/article/S0923-7534(21)04880-8/fulltext
02
研究：完全接种疫苗的人仍有感染奥密克戎变体的风险
一项新研究表明，以前感染过COVID-19的人和完全接种疫苗的人都有感染奥密克戎变体的风险，而且奥密克戎对目前临床上使用的所有抗体都有完全抗性。哥伦比亚大学的研究人员与中国香港大学的科学家合作进行的一项新研究增加了更多的证据，表明奥密克戎变体可以逃避疫苗和自然感染所赋予的免疫保护，并表明需要新的疫苗和治疗方法来预测该病毒可能很快就会演变的情况。
这些发现于2021年12月23日发表在《自然》杂志上，作者是亚伦-戴蒙德艾滋病研究中心主任、哥伦比亚大学瓦格洛斯医学院Clyde'56和Helen Wu医学教授David Ho博士。
奥密克戎变体的一个引人注目的特点是病毒的刺突蛋白的变化数量惊人，可能对目前疫苗和治疗性抗体的有效性构成威胁。
这项新研究在实验室试验中测试了通过接种疫苗产生的抗体中和奥密克戎变体的能力，该试验将抗体与活病毒和在实验室中构建的模仿奥密克戎的假病毒进行对比。
与原始病毒相比，使用四种最广泛使用的疫苗（Moderna、辉瑞、阿斯利康、强生）中和奥密克戎变体的抗体相比效果明显较差。来自先前感染者的抗体甚至不太可能中和奥密克戎变体。
接种过两种mRNA疫苗中任何一种的加强针注射的人可能会得到更好的保护，尽管即使他们的抗体对奥密克戎的中和活性也表现得很弱。
“新的结果表明，以前被感染的人和完全接种过疫苗的人都有感染奥密克戎变体的风险，”Ho说。“即使是第三针加强针注射也可能无法充分保护人们免受奥密克戎感染，但当然最好还是注射一次，因为你仍然会从一些免疫力中受益。”
该结果与其他中和研究以及南非和英国的早期流行病学数据一致，这些数据显示，两剂疫苗对奥密克戎变体的有效性明显降低。
当在感染过程的早期使用时，单克隆抗体可以防止许多人发展成严重的COVID。但新的研究表明，目前使用的所有疗法和正在开发的大多数疗法对奥密克戎变体的效果都要差得多，如果它们根本不起作用的话。
在用单克隆抗体进行的中和研究中，只有一种（中国批准的Brii198）对奥密克戎保持明显的活性。奥密克戎变体对目前临床上使用的所有抗体都有抗性。作者指出，奥密克戎现在是科学家们见过的最彻底的中和“逃亡者”。
在这项研究中，Ho的实验室还在奥密克戎变体中发现了四个新的刺突突变，帮助病毒逃避抗体。这一信息应该为设计打击新变体的新方法提供参考。
Ho建议，科学家将需要开发能够更好地预测病毒如何演变的疫苗和治疗。Ho说：“认为 SARS-CoV-2 现在距离完全抵抗当前抗体仅一两个突变并不太牵强，无论是用作治疗的单克隆抗体还是疫苗接种或感染先前变体产生的抗体。”
https://www.nature.com/articles/d41586-021-03826-3
03
研究发现新冠病毒会影响精子质量：三个月后恢复正常
比利时的科学家发表在《生育与不育》（Fertility and Sterility）杂志上的一项研究显示，新冠病毒会影响男性的精子质量，但在三个月后基本上能够恢复正常。虽然此前有研究表明感染新冠病毒的病例中，其精液中并没有新冠病毒，也意味着该病毒并不能通过性行为传播。
但是并没有说明该病毒会不会对男性的精子质量产生影响。
为此，科学家开展了一项研究。该研究召集了120名未接种新冠疫苗的男性受试者，平均年龄为35岁。在受试者感染新冠病毒后的不同时期开始收集精子样本。
结果显示，在感染新冠病毒的第一个月内，37%的受试者精子数量减少，60%的受试者精子流动性降低。在一到两个月之间，受试者精子数量减少的比例约为29%，37%的人精子流动性降低。
而在两个月后，仅有6%的受试者精子数量下降，四分之一左右的受试者精子流动性降低。随着时间的推进，受试者的精子质量和数量受到新冠病毒的影响进一步降低。
研究人员表示，在研究期间，未发现受试者的精液中有新冠病毒。但在感染新冠病毒后，精子质量预计恢复正常的时间在三个月左右，对于新冠患者来说，建议在三个月后准备怀孕计划。
04
研究表明Omicron冠状病毒变种感染病例住院治疗比例相对较低
根据南非、丹麦和英国的医疗数据，与Delta病毒株的病例相比，感染Omicron冠状病毒变体的人可能需要住院治疗的比例较低。不同研究小组的研究结果让人们看到了希望，与其他病毒株引起的病例相比，严重疾病将减少，但研究人员警告说，Omicron的高度传染性仍然可能给卫生服务带来压力。
专家们强调，重症的减少可能是由于Omicron与其他变种相比，更倾向于感染已接种疫苗的人或以前被感染的人，尽管英国的研究也暗示了内在危害性的可能下降。
未接种疫苗的群体仍然是风险最大的群体，但是由于Omicron引起的绝大多数突破性感染和再感染都是温和的，所有病例中发展为严重疾病的比例比其他变种要低。该毒株现在在包括美国在内的几个国家占了COVID-19病例的大多数。
帝国理工学院的研究人员对英国的数据进行了分析，发现在调整了包括年龄、性别、潜在的健康状况、疫苗接种状态和先前的感染等因素后，Omicron在任何特定个体中产生严重疾病的可能性要低11％。
在人口层面上，这意味着相对于Delta而言，住院风险降低了25%，更大幅度的下降是由于Omicron病例比Delta病例更有可能出现在以前感染过或接种过疫苗的人群中，从而对严重疾病提供了实质性保护。
由南非国家传染病研究所进行的这项研究发现，在10月和11月期间检测结果呈阳性的人中，在对包括先前感染在内的各种因素进行调整后，疑似Omicron病例比Delta病例入院的可能性低80%。但研究人员强调，他们在这项分析中没有考虑到疫苗接种状况，而且关于先前感染的数据也不可靠。
同一研究小组的第二项分析，这次控制了疫苗接种状态，发现一旦入院，最近几周的Omicron和Delta病例都有同样的可能性发展成严重的情况。这些分析包括超过10000个Omicron病例和超过200个入院病例。
威特沃特斯兰德大学的流行病学家、该研究的作者之一Cheryl Cohen教授说："就Omicron与Delta的免疫反应的差异而言，有一些事情正在发生。研究结果表明，Omicron的突破性感染和再感染'不太严重'，尽管抗体保护下降，但T细胞和B细胞的免疫保护阻止了Omicron'向严重疾病的发展'。"
Cohen说，医院负担的减轻使南非能够在不实施封锁的情况下应对Omicron浪潮，但她告诫说，这些发现可能不适用于人口较多的西方国家。因为如果数字如此之大，即使每个案例的严重疾病风险较小，它仍然会造成大量的公共卫生问题。
另外，丹麦的数据显示，在11月22日至12月15日期间检测出阳性的人中，Omicron病例入院的可能性比其他变种的病例低三倍。但是专家警告说，Omicron的爆发集中在年轻群体中，这可能会使数据出现偏差。
丹麦公共卫生机构Statens Serum Institut主任Henrik Ullum在周三的新闻发布会上说："感染Omicron的主要是年轻人和接种疫苗的人，当我们对此进行调查时，我们没有看到任何证据表明Omicron会带来更温和的疾病。"
但是，虽然还没有证据表明严重程度有任何内在的降低，但这并不排除Omicron在人口层面上导致更少的严重后果，因为更多的病例是在通过先前的感染或疫苗接种对严重疾病有一些保护的人中发生的。
哥本哈根大学机器学习和公共卫生教授、英国政府SPI-M建模小组成员Samir Bhatt教授说："由于Omicron的免疫逃避能力较强，这种模式[住院病例较少]将在人口层面的评估中持续存在。"英国政府正在等待关于Omicron严重性的新数据，然后再决定在英格兰的进一步社会限制。
"我觉得医院压力的积累会更慢，更少，因为疫苗似乎仍然具有保护作用，"斯塔滕斯血清研究所的病毒和微生物专家诊断负责人Thea Kolsen Fischer教授说。
但她补充说，政策制定者应该对"关于它更温和的说法需要更小心求证"，因为在变种对医院的影响变得清晰之前，至少还需要好几周。她更担心由于Omicron的传染性让我们现在看到的情况在大约两周后变得非常不同。
周日，丹麦出台了一套措施来控制Omicron的传播，包括关闭剧院和博物馆，以及限制酒吧、餐馆和购物中心的同时迎客量。
哥本哈根最大的医院Rigshospitalet的临床免疫学家Peter Garred教授说，严重程度的下降可能使英国和美国等国家不施加限制的决定"几乎是站不住脚的"，因为无论严重程度如何，感染率都在急剧上升。"
威特沃特斯兰德大学的科恩说，由于Omicron浪潮恰逢冬季，它在北半球的"结果可能不同"，但她补充说，南非的积极迹象"与其他国家以及他们如何应对有很大的关系"。
"在这一点上，大多数人群要么以前感染过，要么接种过疫苗，要么两者都有，"科恩说。"如果坚持下去，所有国家都将看到与我们类似的效果，这很可能是事实。"
05
科学家在俄亥俄州6个地点的野鹿中检测到活跃的新冠感染 至少有三种变体
根据一项新研究，科学家们在俄亥俄州东北部六个地方的自由放养的白尾鹿中检测到至少三种引起COVID-19的病毒变体的感染。之前由美国农业部领导的研究显示了野生鹿体内的抗体证据。
12月23日发表在《自然》杂志上的这项研究，详细介绍了白尾鹿中活跃COVID-19感染的第一份报告，该报告得到了实验室中病毒分离物生长的支持，表明研究人员已经恢复了SARS-CoV-2病毒的可行样本，而不仅仅是其基因痕迹。
根据2021年1月至3月间收集的样本的基因组测序，研究人员确定感染野鹿的变体与当时在俄亥俄州COVID-19患者中流行的SARS-CoV-2病毒株相匹配。样本收集发生在德尔塔变体普遍存在之前，而且该变体在这些鹿身上没有被检测到。该小组正在测试更多的样本，以检查新的变体和旧的变体，这些变体的持续存在将表明病毒可以在这个物种中传播并生存。
该论文的资深作者、俄亥俄州立大学兽医预防医学副教授Andrew Bowman说，野生鹿能够被感染的事实 “导致我们实际上可能已经在人类之外建立了一个新的维持宿主”。
“根据其他研究的证据，我们知道它们在野外被暴露，在实验室里我们可以感染它们，病毒可以从鹿身上传播到鹿。在这里，我们说在野外，它们被感染了，”Bowman说。“如果它们能够维持，我们就有了一个新的SARS-CoV-2的潜在来源进入人类。这将意味着，除了追踪人身上的东西，我们还需要知道鹿身上的东西。”
“这可能会使未来对COVID-19的缓解和控制计划复杂化。”
研究人员指出，很多未知因素仍然存在：鹿是如何被感染的，它们是否能感染人类和其他物种，病毒在动物体内的表现如何，以及它是暂时性的还是长期的感染。
研究小组从俄亥俄州东北部9个地方的360只白尾鹿身上采集了鼻腔拭子。利用PCR检测方法，科学家们在129只（35.8%）取样的鹿身上检测到来自至少三种不同病毒株的遗传物质。
分析结果显示，2021年最初几个月在俄亥俄州占主导地位的B.1.2病毒多次传播到不同地点的鹿群中。
“基于我们的序列的工作理论是，人类把它传给了鹿，显然传播了几次，”Bowman说。“我们有证据表明有六种不同的病毒被引入到这些鹿群中。这不是说一个单一的种群得到了它一次，然后它就扩散了。”
每个地点的采样次数在1到3次之间，加起来共有18个样本采集日期。根据研究结果，研究人员估计九个地点的感染率从13.5%到70%不等，其中四个地点的感染率最高，这些地点周围都是人口比较密集的社区。
Bowman说，白尾鹿作为SARS-CoV-2的病毒库，可能会导致两种结果之一。该病毒可能在鹿体内发生变异，可能会促进新的病毒株传播给其他物种，包括人类，或者该病毒可能在鹿体内未发生变异而在人类体内继续进化，当人类对感染鹿的病毒株没有免疫力时，这些变体可能会重新传播到人类身上。
在这些鹿身上最初是如何发生传播的，以及它如何在不同的物种间发生，是与这些发现有关的未决问题。研究小组推测，白尾鹿是通过环境途径感染的--可能是饮用了被污染的水。研究表明，该病毒会在人类的粪便中脱落，并可在废水中检测到。
为这项研究测试的白尾鹿是种群数量控制计划的一部分，因此它们不是传播威胁。
虽然俄亥俄州估计有60万只白尾鹿，美国有3000万只白尾鹿，但Bowman说，这次取样的重点是靠近人类密集区的地方，不能代表所有自由放养的鹿。
https://www.nature.com/articles/s41586-021-04353-x
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美国食品和药物管理局批准了第二种COVID-19抗病毒药物
美国食品和药物管理局周四批准了第二种用于治疗COVID-19的家用抗病毒药。该药物被称为Molnupiravir（莫努匹韦），它在该机构签署辉瑞公司的COVID-19抗病毒药物（称为Paxlovid）的一天后获得批准。这两种药物都能降低被诊断为COVID-19病毒并有可能患上该疾病严重病例的人的住院和死亡风险。
由制药公司默克(Merck)制造的莫努匹韦被授权用于18岁及以上的人，这些人如果感染冠状病毒，就有患重病的较高风险。美国食品和药物管理局在一份声明中说，值得注意的是这比昨天批准的Paxlovid有着更高的年龄界限，Paxlovid被批准用于12岁及以上人群，因为今天莫努匹韦可能影响骨骼和软骨的生长。
与Paxlovid一样，患者必须在出现症状的几天内开始服用默克公司的药物，以使其发挥最大效力。这在美国可能很困难，因为在美国，确认某人患有COVID-19的测试往往是缓慢和有限的，特别是在最需要治疗的病例数量激增时。
莫努匹韦最初在一项临床试验中似乎将住院和死亡的风险降低了一半左右。然而，额外的评估发现，它只有大约30%的效果。这远不如Paxlovid有效，后者在一项临床试验中使高危人群的住院和死亡人数减少了89%。
尽管疗效较差，美国在不久的将来可能会依赖莫努匹拉韦，拜登政府预计到1月底将有300万个疗程的莫努匹韦剂量可用，但只能生产出26.5万个疗程的Paxlovid。联邦政府在昨天授权后开始向各州分配Paxlovid的疗程。
07
美国大学模型预测：全美未来两月或激增1.4亿确诊
奥密克戎毒株来势汹汹，新冠疫情在全美多地重新呈上升态势。最新的一项模型预测，之后两个月情况可能还要严重得多。研究者还认为，虽然每天可能新增上百万个病例，但可能只有大约40万例会上报。
据报道，华盛顿大学医学院的专家最近修正了他们的新冠疫情预测模型，以反映奥密克戎毒株的影响。新模型显示，2022年1月1日至3月1日期间，美国可能激增1.4亿例新感染，其中最高峰将出现在1月底，每天新增280万例。
图为《今日美国》报道截图。
这项研究的负责人穆雷（Chris Murray）12月22日表示：“我们预计 奥密克戎毒株的感染将出现大量增加。原本的预计是未来2-3个月，全美40%的人口会感染奥密克戎毒株；现在这一比例提高到60%．”
穆雷同时指出，奥密克戎毒株感染者中，可能有多达90%的人不会出现症状。
研究者还认为，虽然每天可能新增上百万个病例，但可能只有大约40万例会上报，其他人因为没有症状而不会寻求检测。但即便是这样，疫情数字仍然将打破纪录：今年1月全美疫情最高峰时，平均每天报告大约25万例新增确诊。
穆雷称这一预测是比较悲观的，但仍然有可能出现。另外该预测模型显示，住院和死亡病例不会大幅上升。研究者认为，奥密克戎毒株导致的住院比德尔塔毒株少90%-96%，死亡则少97%-99%．
该模型还显示，阻止病毒传播的最好方式是戴口罩，尤其是如果总人口的80%都能佩戴高质量的口罩时。
自疫情暴发以来，全美的累计新冠确诊人数已达5100万例，死亡逾81万例。奥密克戎毒株已传播至全美50个州。
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首例感染新冠致肺功能衰竭后进行的双肺移植手术细节公开
里斯本的医生们在今年12月17-19日在线举行的欧洲麻醉学和重症监护学会(ESAIC)年会上提交的一份病例报告中报告了一名61岁男子在肺部受到COVID-19不可修复的损害后接受双肺移植的病例。
资料图
据悉，该患者在2021年1月感染了COVID-19并于8月23日出院，这标志着Centro Hospitalar Universitário Lisboa Central医院首次成功为COVID-19幸存者进行肺部移植。
据了解，该名男子有血脂异常（血液中胆固醇和其他脂肪含量异常高）和胃炎（胃黏膜炎症）病史，其于2021年1月12日因SARS-CoV-2肺炎在急诊科入院。
尽管有呼吸机的支持，但由于氧气含量低，他的病情恶化并出现了严重的呼吸困难，这使得他需要接受先进的肺部支持疗法--体外膜肺氧合(ECMO)--完全接管肺部的功能。他在ECMO上呆了74天，然后被换成了体外二氧化碳清除(ECCO2R)--一种旨在清除二氧化碳但不提供如此高的氧气水平的设备。
在这三个月里，他遭受了多种感染--包括肺炎和前列腺炎（前列腺肿胀）、血液方面的并发症--包括血液凝固障碍（ECMO相关的凝血病）和对血液稀释药物肝素的威胁性反应（肝素诱导的血小板减少症）。
“患者约75%的肺部已经被COVID-19留下了疤痕，从他的扫描中可以看出，他的肺部已经永久受损，不会再恢复，”来自entro Hospitalar Universitário Lisboa Central的麻醉师Carolina Almeida博士表示，“病人符合移植的条件，因为他还年轻，足够强壮，能在危险的手术中存活，且没有其他器官受到COVID-19的影响。经过仔细的临床评估，他在5月份接受了拯救生命的器官。”Almeida是进行移植手术的团队成员。
手术历时约7小时，另外术后他还经历了两周的术后重症监护。
康复之旅
移植后已经有六个月了，他的康复绝不是完全的。他的肺功能良好，不再需要白天的氧气支持，但他在康复的道路上仍必须要克服许多挑战，包括心房颤动（心律不齐）、肺塌陷、皮下气肿（空气被困在皮肤下）、2型糖尿病和数次感染。
接下来，他将继续接受康复治疗以改善自己的活动能力、肺功能和生活质量。另外，在余生中，该名男子还必须服用十几种药物以防止器官排斥和感染。
帮助进行移植手术的Centro Hospitalar Universitário Lisboa Central高级麻醉师Lurdes Castro博士表示：“团队非常感谢手术如此顺利，病人得以回家，在家人身边继续康复。克服他所承受的一切需要巨大的意志力，能在给这个病人提供重新生活的机会并回到他的家庭和以前的生活中发挥作用真是太好了。”
09
麻省理工提出量子新冠传感器概念 可提供更快更准确的检测结果
麻省理工学院的研究人员利用数学模拟表明，有可能设计一种基于量子物理学的传感器，可以检测SARS-CoV-2病毒。这种新方法可能提供更快、更便宜和更准确的检测，包括识别新的变种。
2021年12月16日，麻省理工学院博士生李昌浩、核科学与工程和物理学教授Paola Cappellaro、滑铁卢大学的Rouholla Soleyman和Mohammad Kohandel在《纳米通讯》杂志上发表的一篇论文中描述了这种新方法。现有的SARS-CoV-2病毒测试包括检测特定病毒蛋白的快速测试，以及需要几个小时处理的聚合酶链反应（PCR）测试。这些测试都不能高度准确地量化存在的病毒数量。即使是黄金标准的PCR测试也可能有超过25%的假阴性率。
相比之下，该团队的分析显示，新测试的假阴性率可能低于1%。该测试也可能足够敏感，在短短一秒钟内就能检测到几百股病毒RNA。研究人员说，该传感器只使用低成本的材料，而且这些设备可以扩大规模，一次性分析一整批样品。这种新方法利用了微小钻石中的原子级缺陷，即所谓的氮空位（NV）中心。由于钻石晶格中发生的量子效应，这些微小的缺陷对微小的扰动极为敏感，并且正在被探索用于各种需要高灵敏度的传感设备。
这种新方法将涉及在含有这些NV中心的纳米金刚石上涂上一种磁耦合的材料，这种材料经过处理，只与病毒的特定RNA序列结合。当病毒RNA出现并与这种材料结合时，它破坏了磁性连接并导致钻石的荧光发生变化，这种变化很容易被基于激光的光学传感器检测到。基于钆的涂层及其RNA调谐的有机分子可以用普通的化学工艺和材料来生产，而用于读出结果的激光器与廉价的、可广泛使用的商业绿色激光指示器相当。
虽然这项初步工作是基于详细的数学模拟，证明该系统可以在原则上工作，但该团队正在继续努力将其转化为一个可工作的实验室规模设备。他们的计划是首先做一个基本的原理证明实验室测试，然后研究如何优化该系统，使其在真正的病毒诊断应用中发挥作用。
这个多学科的过程需要结合量子物理学工和程学的专业知识来生产探测器本身，以及化学和生物学专业知识来开发与病毒RNA结合的分子，并找到将这些分子粘合到钻石表面的方法。即使准确度相同，这种方法在几分钟内产生结果方面仍有很大优势，而不是需要几个小时。
这种基本方法可以适用于任何病毒，包括可能出现的任何新病毒，只需调整附着在纳米金刚石传感器上的化合物，使其与特定目标病毒的通用材料相匹配即可。
10
研究：类风湿性关节炎药物可更有效地治疗新冠肺炎住院患者
由伯明翰大学和伯明翰大学医院NHS基金会信托基金领导的一项概念验证试验已经确定了一种药物，可能使一些住院的新冠肺炎患者受益。
CATALYST试验测试了英国生物制药公司Izana Bioscience的namilumab（IZN-101）药物作为一种潜在的治疗方法，用于治疗因COVID-19肺炎而住院、接受“常规”护理以及血液中一种被称为C反应蛋白（CRP）的炎症标志物的高水平的患者。当体内有炎症时，CRP水平会上升，而且CRP水平的升高已被发现是预测COVID-19重症风险的潜在早期标志物。
namilumab是一种已经进入后期试验的治疗类风湿性关节炎的抗体药物，它针对的是一种“细胞因子”，它由体内的免疫细胞自然分泌，但在不受控制的情况下，被认为是COVID-19患者出现过度和危险的肺部炎症的一个关键驱动因素。
这项试验是与牛津大学合作进行的，由医学研究委员会资助，在2020年6月至2021年2月期间进行，涉及16岁以上的COVID-19肺炎患者，他们在英国9家NHS医院的病房或重症监护室接受治疗。
这项研究于12月16日发表在《柳叶刀·呼吸医学》杂志上，涉及54名接受“常规护理”（类固醇和氧气或通气，取决于疾病的严重程度）的患者，以及57名接受常规护理以及单次静脉注射150mg namilumab的患者。
除了COVID-19肺炎，所有研究参与者的CRP水平都大于40mg/l。研究人员比较了患者CRP水平降低的概率。研究人员发现，与单独的常规护理相比，给予namilumab的患者CRP随着时间的推移降低的概率为97%。
研究还显示，对病人进行监测，28天后，，与那些单独接受常规护理的病人相比，那些被给予namilumab的病人死亡人数更少，出院人数更多。
到第28天，78%（43人）接受namilumab的病人出院或离开ICU，而接受常规护理的病人只有61%（33人）。在纳米鲁单抗组中，11%（6人）到第28天仍在医院，而常规护理组为20%（11人）。在namilumab组中，11%（6人）的患者死亡，而常规护理组中，19%（10人）的患者在第28天时死亡。
研究小组计算了两组患者在28天时从ICU或病房出院的总体概率的差异。在病房中，常规护理组在第28天出院的概率为64%，而namilumab组则为77%。在重症监护室的患者中，常规护理组在第28天出院的概率为47%，而namilumab队列中为66%。
伯明翰大学炎症和老龄化研究所CATALYST试验的联合首席调查员、伯明翰大学医院NHS基金会信托基金（UHB）的风湿病顾问Ben Fisher博士说：“我们的研究提供了重要的概念验证证据，证明namilumab能减少COVID-19肺炎住院患者的炎症。然而，我们的样本量太小，无法对临床结果进行明确的评估，为此需要进一步的研究，也需要更好地了解可能受益最大的人群。我们的结果可能无法推广到没有肺炎证据或CRP升高的住院患者或不需要住院的患者。因此，重要的是，namilumab现在被优先安排在一个更大的国家III期临床试验中进行进一步的COVID-19研究。”
Izana生物科学公司的联合创始人Someit Sidhu博士说：“我们很自豪能够支持由伯明翰大学和欧洲最大的综合重症监护中心UHB的经验丰富的团队领导的CATALYST试验。我们相信namilumab可以在抑制严重的COVID-19感染患者的高炎症方面发挥重要作用，并致力于与世界各地的监管机构和合作伙伴合作，以确保这种潜在的疗法可以为急需治疗的COVID-19患者开发。这对我来说是一个特别重要的时刻，通过伯明翰大学医院团队的工作支持全球对这一流行病的反应--我在创立Izana之前就是在这家医院接受初级医生培训。”
CATALYST团队还测试了第二种名为infliximab （CT-P13）的药物，目前被用作治疗炎症的药物。他们将接受"常规护理"的患有COVID-19肺炎和CRP水平大于40mg/l的相同患者，与接受常规护理和单次静脉注射5mg/kg英夫利西单抗的35名患者进行了比较。然而，研究发现infliximab 并不比常规护理更有效，CRP降低的概率仅为15%。
Fisher博士补充说：“我们与infliximab有关的研究结果虽然令人失望，但也很重要，因为我们在继续调查和确定现有的和新的抗炎药物，它们可能在针对和减少COVID-19的最严重症状方面发挥关键作用。”
https://www.thelancet.com/journals/lanres/article/PIIS2213-2600(21)00460-4/fulltext
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英国研究发现奥密克戎变体传播速度快 “没有证据”表明它比德尔塔更温和
伦敦帝国理工学院的新数据发现，与之前的SARS-CoV-2变体相比，“没有证据”表明感染奥密克戎变体会产生较轻的症状。对挪威发生的奥密克戎超级传播事件的分析也为了解这种新变体的特点及其突破原有免疫力的能力提供了关键性的见解。
最新的发现来自帝国理工学院的COVID-19反应小组，该小组自COVID-19大流行开始以来一直在提供关于SARS-CoV-2传播的实时模型。证实了牛津大学实验室最近的一项研究结果，表明两剂疫苗不足以保护奥密克戎感染，新的现实世界的数据发现新的变体明显回避了疫苗和以前感染产生的免疫力。
通过追踪英国两周左右的病例数据，该报告估计，与德尔塔变体的再感染率相比，奥密克戎与先前感染病毒的人再感染的风险高 5.4 倍有关。从疫苗的有效性来看，报告估计两剂疫苗对有症状的奥密克戎感染提供了零到20%的保护。
报告作者之一Neil Ferguson说：“这项研究提供了进一步的证据，证明奥密克戎变体可以在很大程度上规避由感染或疫苗接种给予的先前免疫力。这种程度的免疫规避意味着奥密克戎对公共健康构成了重大的、迫在眉睫的威胁。”
虽然这个关于奥密克戎突破了对SARS-CoV-2已有的免疫力的新数据得到了来自世界各地越来越多的证据的支持，但目前仍不清楚这个变体引起的疾病究竟会有多严重。尽管来自南非第一波奥密克戎疫情的初步迹象表明，与以前的变体相比，这种变体可能是温和的，但英国的新数据表明，“没有证据 ”表明这是真的。
研究人员在报告中说：“我们没有发现奥密克戎与德尔塔有不同严重性的证据（住院风险和症状状况），尽管住院的数据仍然非常有限。”
研究人员目前在确定奥密克戎引起的疾病的严重性方面所面临的巨大挑战是，与之前的变体相比，这种新的变体正在出现在一个预先存在的人群免疫力水平根本不同的世界上。例如，科学家们花了几个月的时间才清楚地确定，与SARS-CoV-2的早期毒株相比，德尔塔变体引起的疾病更加严重。即使如此，由于先前的感染和疫苗诱导的免疫力，德尔塔并没有导致与先前变体相比更大的死亡率高峰。
传染病专家Roby Bhattacharyya和William Hanage最近发表的一份工作文件概述了在将目前的住院率和死亡率与该大流行的早期点进行比较时估计奥密克戎的严重性的挑战。两人解释说，由于先前的感染和疫苗接种率，感染奥密克戎的严重性可能会被 “系统地低估”。
Bhattacharyya和Hanage写道：“虽然在南非奥密克戎疫情的早期几周观察到的IFR（感染死亡率）较低，但最有可能的解释是被感染者的免疫力增强；需要更多的时间和仔细的比较，控制年龄、先前的免疫力、检测偏差、滞后期、医院能力和许多其他因素，以推断内在的毒力 。我们对人口水平的IFR与变体内在严重性的关系的集体直觉需要随着时间的推移，随着免疫力的累积而重新调整，对于像奥密克戎这样具有免疫力的变体来说更是如此。"
挪威超级传播事件凸显了奥密克戎的传播速度
尽管奥密克戎疾病的严重性问题可能还需要几周的时间来回答，但对奥密克戎早期超级传播者事件的调查正在为这个新变体的特征提供关键的见解。发表在《Eurosurveillance》杂志上的一项新研究分析了11月底在挪威的一个圣诞聚会上发生的大规模感染事件。
总共有117人参加了这次活动，包括最近从南非旅行回来的索引病例。大多数与会者都接种了两剂疫苗，并在活动后两天内进行了PCR检测。到12月13日，活动中的81人对SARS-CoV-2检测呈阳性。这些病例中的大多数在活动后三天内开始出现症状，这表明奥密克戎的平均潜伏期比以前的变体要短。
只有一个阳性病例是无症状的，这是奥密克戎的另一个不寻常的特征。报告的最常见的症状是咳嗽，鼻塞、疲劳和喉咙痛在大多数受感染的病例中也很常见。
截止到12月13日，没有一个确诊病例需要住院治疗。大约一半的阳性病例自我报告说他们的症状在零到五级的严重程度中为三级。
挪威公共卫生研究所（NIPH）的一份早期声明指出，该队列的平均年龄为30多岁，因此这些发现不能为更多的弱势群体或老年人群中奥密克戎感染的广泛严重性提供见解。该分析的主要启示是奥密克戎的传播性有多强，以及它能多么容易地感染那些接种了两剂COVID-19疫苗的人。
“尽管大多数病例目前还没有严重的症状，但几乎所有的人都在圣诞聚会后相对较快地出现了症状，”NIPH在最近的一份声明中报告说。“与会人员都很年轻，而且充分接种了疫苗，通常不会在感染SARS-CoV-2后出现严重的疾病。因此，根据这些初步结果，很难对这种变体的疾病严重程度作出评论。”
帝国理工学院的传染病研究员Alexandra Hogan说，新出现的数据肯定了三个疫苗剂量对防止奥密克戎传播的重要性。虽然了解奥密克戎疾病的严重性还需要一段时间，但Hogan说很明显奥密克戎将在未来几周内在未接种疫苗和两剂疫苗的人群中迅速传播。
Hogan说：“虽然数据仍在不断出现，但奥密克戎变体的快速传播令人高度关注。预计在未来几周内，无论是在病毒持续传播的国家，还是在那些以前抑制了传播、现在正在取消限制的环境中，感染和病例都将大幅增加。”
帝国理工学院的新报告可以在这里找到。
https://www.imperial.ac.uk/mrc-global-infectious-disease-analysis/covid-19/report-49-omicron/
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COVID-19变体并不是NIH科学家们敦促追求通用冠状病毒疫苗的唯一原因
根据一项新研究，越来越多的科学证据与生态学现实相结合，强烈表明新冠病毒将继续感染蝙蝠和其他动物，并有可能出现对人类构成大流行的威胁。为了应对未来的冠状病毒爆发，科学家认为全球科学和医学研究界现在应该把主要精力放在三个目标上：确定多种动物物种中冠状病毒遗传多样性的范围；更好地了解实验室动物模型和人类的冠状病毒疾病发病机制；并将这些知识用于开发持久的、具有广泛保护作用的冠状病毒疫苗。
美国国立卫生研究院（NIH）下属的国家过敏症和传染病研究所（NIAID）的医学博士安东尼·福奇、医学博士杰弗里·陶本伯格和医学博士大卫·莫恩斯在《新英格兰医学杂志》的一篇新评论中这样认为。
研究作者呼吁开展国际合作，从蝙蝠以及野生和养殖的动物身上广泛采集冠状病毒样本，以帮助了解现有和新出现的冠状病毒的全部“宇宙”。他们表示，这样的研究可以对准备在人类中引起爆发的冠状病毒提供早期预警。他们写道，精心控制的人类挑战试验，即志愿者接触冠状病毒，可以产生对冠状病毒疾病过程更全面的理解，并为疫苗设计提供信息。
NIAID的作者们指出，尽管有安全、有效的COVID-19疫苗，但是否以及如何实现永久免疫力仍然是个未知数。他们表示，引起COVID-19的病毒SARS-CoV-2可能将继续无限期地循环，定期爆发，而且传播性和致命性未知的动物冠状病毒可能随时出现。因此，研究人员必须大大加快在冠状病毒疫苗学方面的努力。
作者概述了理想的通用冠状病毒疫苗的特点，这种疫苗将为所有年龄段的个人和整个社区提供对大多数或所有冠状病毒的持久保护。为了实现这一目标，他们认为必须解决有关冠状病毒保护性免疫性质的基本问题，包括什么疫苗方法能最好地引起快速反应（例如抗体）和持久的免疫“记忆”反应，从而抵御新出现的冠状病毒。
他们认为，仍在肆虐的COVID-19大流行，加上新的冠状病毒的威胁始终存在，因此有必要迅速开发安全和广泛保护的冠状病毒疫苗。作者总结说，这是一个我们现在必须全力以赴解决的挑战。
https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMp2118468
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复制RNA比复制DNA更容易出错：对付新冠或需要“泛冠状病毒疫苗”
病毒通过接管宿主细胞的复制机器来复制自己的遗传物质或基因组进行繁殖。跟细胞生物的基因组由DNA构成不同，病毒可以将其基因组编码为DNA或RNA。像SARS-CoV-2这样的冠状病毒则能使用RNA来存储它们的遗传信息，而复制RNA比复制DNA更容易出错。
研究人员指出，当冠状病毒复制时，约3%的副本会包含一个新的随机错误--这也被称为突变。
一种在人群中广泛流传并引起许多感染的病毒拥有更多的复制机会从而发生突变。大多数突变是无关紧要的小问题，不会对病毒的工作方式产生重大影响，还有一些甚至可能对病毒有害。但一小部分却会被证明对病毒有利，如使其更具感染性。
当病毒在复制过程中发生变异时，由此产生的病毒变异版本被称为变体。公共卫生机构可能会给具有某种特征或属性的变体组贴上特殊标签。这些群体可能包含来自一个单一血统的变体，就像家谱中的遗传性状或那些独立产生但行为相似的变体。在SARS-CoV-2的案例中，变体是用希腊字母来分类和标记的，如拥有极高传播性的德尔塔(δ)奥密克戎(ο)变体。
虽然不可能阻止SARS-CoV-2变异，但卫生专家说，通过限制病毒的传播有可能减少出现新的和更致命的变异的机会。这就是为什么佩戴口罩、保持社交距离和疫苗接种等公共卫生干预措施非常重要：它们减少了病毒可以复制的总次数，从而减少了它可以发展出更危险的变异的机会。
在大流行的过程中，在英国、巴西、加利福尼亚、南非和其他地区出现了许多SARS-CoV-2变体。其中，德尔塔变体于2020年底起源于印度并在几个月内传播到60多个国家，目前是美国最主要的病毒变体。跟其他变体相比，德尔塔变体的传染性约为2倍，早期数据表明，跟以前的变体相比，它可以在未接种疫苗的人群中引起更严重的疾病。
变种的扩散促使人们担心它们可能使现有的疫苗变得不那么有效。因为COVID-19疫苗针对的是SARS-CoV-2的一个特定区域--刺突蛋白，那里基因的突变可能会导致病毒甚至在已经接种疫苗的人中引起疾病。
但目前正在开发的COVID-19疫苗或已经获得批准的疫苗通过激发广泛的免疫反应发挥作用，因此预计至少可以对新的病毒变种提供一些保护。事实上，早期研究表明，由辉瑞-BioNTech、Moderna和强生公司开发的疫苗对预防德尔塔变体引起的严重疾病都非常有效。
世界卫生组织(WHO)和美国疾病控制和预防中心(CDC)将变体分为不同的类别：
一个值得关注的变体是SARS-CoV-2变体，跟该病毒的早期形式相比，它的突变被预测为会导致更大的传播性、逃避免疫系统或诊断测试或更严重的疾病；
一个值得关注的变体已被观察到具有更强的传染性，更有可能造成突破性感染。德尔塔变体就属于这一类别；
一个后果严重的变体是目前的疫苗无法提供保护的变体。目前没有SARS-CoV-2的变体属于这一类别。
辉瑞-BioNTech和Moderna的疫苗所使用的mRNA疫苗技术使公司能比病毒载体或基于蛋白质的方法更快地创造一种新的疫苗或增强剂。药物公司已经开始调整疫苗以针对已知的变体并在动物身上测试这些调整。调整后疫苗的临床试验过程比用于获得紧急使用授权的试验过程要短。
由于大多数冠状病毒都有其穗状蛋白的共同区域，一些科学家正在探索开发一种“泛冠状病毒(pancoronavirus)”疫苗的可能性，以来针对这些共同区域并提供对变种和其他类型冠状病毒的保护。
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研究：mRNA疫苗在预防新冠死亡方面非常有效 但预防感染效果不佳
一项目标试验模拟研究发现，在合并症负担较重的美国退伍军人老年人群中，mRNA疫苗预防COVID-19感染的有效性大大低于之前的报告，但对死亡的有效性非常高。这些发现表明，即使有接种疫苗，补充性的感染缓解工作对COVID-19大流行的控制仍然很重要。该研究发表在《内科学年鉴》上。
Moderna或辉瑞-BioNTech COVID-19 mRNA疫苗在整个美国不同民族和种族的人群中的实际效果没有得到很好的描述，特别是在更脆弱的人群中，如合并症负担较重的老年人。美国退伍军人事务部（VA）的医疗保健系统是美国最大的国家综合医疗保健系统。因此，它为评估这一人群的疫苗提供了机会。
来自退伍军人事务部普吉特海湾医疗保健系统和华盛顿大学医学院的研究人员设计了一项观察性研究，模仿COVID-19疫苗接种与安慰剂的目标试验。在退伍军人事务保健系统接受护理的500多万人中，从2020年12月11日至2021年3月25日接受至少1剂Moderna或辉瑞-BioNTech COVID-19疫苗的人（n = 2,099,871），根据人口、临床和地理特征，以1:1的比例与未接种的对照组匹配。
研究人员发现，在延伸至2021年6月30日的随访期间，在第二剂疫苗后7天或更长时间内，疫苗对SARS-CoV-2感染的有效性为69%，对SARS-CoV-2相关死亡的有效性为86%。当随访时间从3月31日延长到2021年6月30日时，疫苗的有效性并没有下降。疫苗对SARS-CoV-2感染的有效性随着年龄和合并症负担的增加而下降。据研究人员称，这些发现表明，即使在接种疫苗的人中，对COVID-19感染的保护也需要继续关注其他缓解策略。
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研究：预防未来的大流行病要先认识到人畜共患疾病的巨大威胁
COVID-19大流行表明，人畜共患疾病--从动物传给人类的感染--可能对全球健康构成巨大威胁。据悉，超70%的新出现和重新出现的病原体来自于动物。而这可能包括SARS CoV-2病毒，科学家们普遍认为它起源于蝙蝠。
关于SARS-CoV-2病毒的具体出现地点仍有疑问。但全球各地的专家都同意，社区可以采取措施减少未来病毒外溢的风险。一个关键是兽医、医生和科学家共同合作以认识到人类的健康跟动物的健康以及我们共享的栖息地的健康是多么密切相关--这种方法被称为One Health。
为了防止新的大流行病的发生，科学家需要确定病毒最有可能从动物跳到人类的具体地点。反过来，这需要了解人类的行为--从砍伐森林到燃烧化石燃料到冲突到文化活动--是如何造成外溢风险的。
由哈佛大学陈曾熙公共卫生学院和哈佛大学全球健康研究所召集的一个科学工作队的报告指出，最近的一项分析估计，通过One Health方法和森林保护来解决高风险界面的外溢问题，每年的成本为220亿至310亿美元。这些成本跟2020年因COVID-19大流行病造成的近4万亿美元的全球GDP估计损失相比相形见绌。
科学家们认为，需要基于One Health方法的协调投资以启动和维持全球预防战略，进而避免大流行病应对的破坏性成本。
识别风险区
识别人畜共患传染病的高风险区是一个挑战。人们和野生动物经常走动且接触可能不会立即导致感染或产生明显反映接触病原体的症状。
但研究人员可以通过将人类和牲畜密度的数据跟环境条件（如森林砍伐和土地利用变化）的数据结合起来进行预测，这些数据可以使病原体从野生动物传播到人类。
蝙蝠传播的疾病蔓延到人类身上的情况并不少见，有时它直接发生。如孟加拉国的蝙蝠曾多次将尼帕病毒传播给人类或病原体可以通过中间宿主间接地转移，再比如在1994年，澳大利亚的蝙蝠使马感染了一种呼吸道疾病--亨德拉病毒，然后传给人类。
在巴西，黄热病在丛林中流行，主要通过蚊子在猴子之间传播。该国的人们偶尔会因为蚊子的叮咬而感染黄热病，而森林砍伐和土地转为耕地的做法正在增加更多的外溢风险。人们越来越担心这种疾病会流入巴西的大城市，那里的埃及伊蚊非常普遍，这将可能会造成大规模的传播。
还有一些特定的人类行为可能会进一步增加外溢的风险--包括使人类直接接触或接近动物的工作，如收获蝙蝠粪便作为肥料、买卖野生动物或动物部分。
跟储存食物和食用野生动物肉有关的日常工作也会产生风险。如埃博拉病毒在尼日利亚的爆发就跟屠宰和食用丛林肉有关。
在有高风险的地区，人们不需要停止生活。但他们确实需要认识到，一些行动比其他行动更有风险并采取适当的安全预防措施，诸如穿戴防护设备、确保丛林肉得到适当的处理和烹调。
团队合作的重要性
研究人员和政府必须理解并接受这样一个核心概念：动物、人和环境的健康是密切相关的，影响一个人的因素同时也会影响到所有的人。理想的情况是，形成解决问题的团队，从社区和地区层面到卫生、动物和环境部的层面都能解决预防问题。
当地社区的成员最有可能知道人们在哪里接触到可能携带传染病的动物的风险最高。通过听取他们的意见，兽医和医疗卫生专业人员及林务人员和土地管理人员可以制定出更有可能减少疾病蔓延风险的策略。
美国国际开发署、联合国粮食及农业组织、各国政府和民间社会团体等组织正在非洲和亚洲的一些国家投资建立One Health平台。这些网络通常以政府各部委为基础。它们还可以包括致力于通过One Health框架促进健康和福祉的非政府组织和民间社会团体。
比如许多国家都有独立的数据库来追踪人类和动物的传染病爆发情况。将政府各部委和机构的这些系统连接起来，可以起到改善它们之间信息交流从而更好地了解外溢风险的作用。
研究人员们认为，为下一次大流行病做准备必须包括从源头上预防。成功的最好机会是协调研究和设计外溢性干预措施并认识到人类、动物和自然的健康是相互关联的。
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研究：COVID-19不同症状的出现顺序取决于变异体
根据南加州大学的Peter Kuhn及其同事于2021年12月16日发表在《PLOS Computational Biology》上的一项新研究，COVID-19患者最可能出现的症状顺序在不同的病毒变体中是不同的。
在新工作中，研究人员们想知道来自不同地理区域的病人或具有不同病人特征的病人的症状顺序是否有所不同。为此，他们使用他们的建模方法对2020年1月至5月期间美国的一组373883个病例中的症状顺序进行了预测。
令人惊讶的是，最可能的症状顺序跟在中国最初的爆发中有所不同--在中国，发烧最常发生在咳嗽之前，恶心/呕吐是常见的第三种症状，而在美国，咳嗽最有可能是第一种症状，腹泻是更常见的第三种症状。研究小组通过分析来自巴西、中国香港地区和日本的其他数据表明，不同的症状顺序跟地理区域、天气或病人特征无关，而是跟SARS-CoV-2变种有关。在一个地区出现D614G变体--2020年初在美国占主导地位--跟咳嗽成为病人经历的第一个COVID-19症状的可能性较高有关。随着日本从最初的菌株转移到D614G变体，症状顺序也发生了变化。研究人员们假设，D614G的传播增加可能跟症状顺序有关。
“这些发现表明，症状顺序可以随着病毒性疾病的突变而改变并提出了D614G变体更具传播性的可能性，因为受感染的人在发烧失去能力之前更可能在公共场合咳嗽，”他们说道。
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世卫：2022年必须终止新冠大流行 美国首现奥密克戎变异株死亡病例
当地时间20日，世界卫生组织总干事谭德塞在日内瓦召开的新闻发布会上表示，2021年新冠肺炎疫情夺走了至少330万人的生命，如今每周依然有50000人直接死于新冠肺炎。谭德塞还表示，数据表明，奥密克戎变异毒株的传播速度快于德尔塔毒株，新冠疫苗接种者或是康复者有可能再次感染该病毒。疫情不仅干扰了人们的正常生活，甚至扰乱其他疾病的筛查、治疗和服务。
谭德塞强调，2022年我们必须终止新冠肺炎大流行。所有国家需要投资预防未来这种规模的灾难，并加快实现可持续发展目标。
据央视新闻报道称，当地时间周一，美国疾控中心数据显示，在仅仅一周内，奥密克戎变异株在美国新增病例的占比就暴增了近六倍，目前，奥密克戎已成为全美最主要的新增病例感染源，占新增病例的73%。
在包括纽约地区、中西部工业区、东南部等地区在内的部分地区，奥密克戎的比例更预计高达90%。而在11月底，全美99.5%的新增病例还是德尔塔毒株。
据美国KTRK-TV新闻电视台报道，美国出现首例奥密克戎变异株死亡病例，为得州南部哈里斯县一名50多岁男子。
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新研究：突破性感染产生对COVID-19的“超级免疫力”
根据俄勒冈健康与科学大学（OHSU）最新发表的一项研究，突破性感染大大增强了对导致COVID-19的病毒变体的免疫反应。在线提前发表在《美国医学会杂志》（JAMA）上的实验室结果显示，突破性感染产生了针对德尔塔变体的强大免疫反应。作者说，这些发现表明，随着SARS-CoV-2病毒的不断变异，免疫反应很可能对其他变体非常有效。
该研究是第一个使用活的SARS-CoV-2变体来测量来自突破性病例的血清的交叉中和。“你无法获得比这更好的免疫反应，”高级作者、OHSU医学院分子微生物学和免疫学助理教授Fikadu Tafesse博士说。“这些疫苗对严重疾病非常有效。我们的研究表明，接种疫苗后暴露于突破性感染的人具有超级免疫力。”
该研究发现，在突破性病例的血样中测得的抗体既丰富又有效得多--多达1000%--比辉瑞公司疫苗第二剂后两周产生的抗体更有效。
该研究表明，接种疫苗后的每次接触实际上都有助于加强对后续接触的免疫反应，甚至是对新的病毒变体的免疫反应。
研究合著者、OHSU医学院医学（传染病）副教授、医学博士Marcel Curlin说：“我认为这说明了一个最终的结局。这并不意味着我们处于大流行的末期，但它指出了我们可能的落脚点。一旦你接种了疫苗，然后接触到病毒，你可能会在未来的变体中得到合理的保护。”
“我们的研究意味着，长期的结果将是世界性流行病的严重性逐渐减弱。”
疫苗免疫力目前正在接受针对新的奥密克戎变体的真实世界测试。Tafesse说：“我们没有具体检查过奥密克戎变体，但是根据这项研究的结果，我们预计来自奥密克戎变体的突破性感染将在接种疫苗的人中产生类似的强烈免疫反应。”
这项研究比较了从总共52人身上采集的血样，这些人都是OHSU的员工，他们接种了辉瑞公司的疫苗并随后加入了这项研究。
通过OHSU职业健康测试，共有26人被确定为在接种疫苗后有轻微的突破性感染。在序列确认的突破性病例中，10人涉及高传染性的德尔塔变体，9人是非德尔塔，7人是未知变体。
研究人员在一个生物安全防护三级实验室工作，然后测量了对暴露在突破性病例患者血液中的活病毒的免疫反应，并与对照组的免疫反应进行了比较。他们发现突破性病例在基线时产生了更多的抗体，而且他们发现这些抗体在中和活病毒方面有很大优势。
由于多达五分之一符合条件的俄勒冈人仍然容易受到感染--而美国其他地方和世界各地的疫苗接种率甚至更低--这项新的研究强调了这样一个事实，即接种疫苗仍然是结束这种大流行病的关键。
“关键是要接种疫苗，”Curlin说。“你必须要有一个保护的基础。”
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美专家分享对COVID-19新变体奥密克戎的看法
世界卫生组织（WHO）命名为奥密克戎的COVID-19严重变异的变体已在多个国家被发现。美国总统拜登的首席医疗官安东尼·福奇博士表示，需要几周时间才能判断奥密克戎的威胁。同时，加州大学河滨分校的专家们分享了他们对这个SARS-CoV-2这个新变体的看法。
传染性疾病和病媒研究中心主任 Karine Le Roch
什么是奥密克戎，它与其他变体有什么不同？
所有的病毒，包括SARS-CoV-2（引起COVID-19的病毒），都会随着时间的推移发生变异。奥密克戎是在数天前在南非发现的一种新的SARS-CoV-2变体。它已被世界卫生组织SAR-CoV-2病毒进化技术咨询小组（TGA-VE）描述为值得关注的变体。奥密克戎基因组中的几个变异已经被发现，包括刺突蛋白的32个变异。刺突蛋白是病毒感染宿主细胞和导致感染的一个重要蛋白质。它也是被用来设计针对COVID-19的疫苗的蛋白质。刺突蛋白的变异可以影响传播和疾病的严重性，但也可以影响疫苗的有效性。虽然需要几天或几周的时间来确定这些突变是否会显著影响传播和疾病的严重程度，但减少COVID-19病毒的传播是很重要的。避免拥挤的空间，戴上口罩，与他人保持物理距离，并全面接种疫苗，因为现有的疫苗仍有可能提供保护，避免严重疾病和死亡。如果我们想更好地了解新冠病毒奥密克戎变体的特点，加强监测，包括检测也将是至关重要的。
医学院生物医学科学特聘教授David Lo博士
我们应该对奥密克戎有多担心？它是否比德尔塔变体更具传播性？
虽然现在了解奥密克戎变体的很多细节还为时过早，但鉴于全球以及美国各地区相对较低的疫苗接种率，出现这样的新变体是可以预期的。序列数据表明，这种新的变体获得了很多新的突变，这些突变需要时间来积累，可能是在一个未免疫的病人身上。它的快速传播--以及已知在世界多个国家的存在--肯定会被世界上大量未接种疫苗的人进一步促成。早期的数据表明，它可能比以前的变体更具传播性，但到今天为止，数字可能太低，还不能确切知道它的传播性有多高。在任何情况下，尽管有很多变异，但似乎有足够的保守序列，因此，接种现有疫苗的人仍然非常可能获得对严重疾病和死亡的显著保护。
更多的人接种疫苗会帮助我们所有人对抗奥密克戎吗？
是的。更高的疫苗接种率显然将有助于降低感染的严重程度，并减少来自受感染者的传播。这也将有助于防止出现新的变体。我们还可以预计，在未来几年，将会有更新的疫苗，这些疫苗是根据科学家对新变种的理解而设计的。
公共政策学院教授Richard M. Carpiano
疫苗的犹豫不决和全球疫苗的不平等是如何促成奥密克戎的出现的？
最近关于奥密克戎变体出现的消息令人担忧，因为它发生在大流行病的一个时期，即疫苗接种已经推出了近一年。美国和其他高收入国家的数亿人已经接种了疫苗，因此他们可能认为这种大流行病几乎已经结束。但最近对奥密克戎的关注迫使我们认识到，疫苗的不平等--例如，由于获取、供应和分配--以及相关的疫苗犹豫情况（由于公众中的错误信息和恶意行为者传播有关疫苗和COVID-19的虚假信息）是影响我们所有人的全球公共卫生威胁，而不仅仅是世界其他地区。不平等和犹豫不决都使许多人得不到保护，因此很容易接触到冠状病毒并将其传染给他人。这是悲惨的，也是不可接受的。此外，通过帮助创造变体传播的条件，疫苗的不平等和犹豫不决也会为高度关注的冠状病毒变种的出现创造机会，正如我们在德尔塔所看到的那样--现有疫苗对这些变体的效果可能不如对以前的变体那样有效。因此，奥密克戎变体（以及之前的变体）的出现和传播突出表明，当涉及到传染病大流行时，全球各地人们的命运是如何交织在一起的--无论他们是否生活在疫苗接种率和覆盖率高的国家。最终，国际合作使疫苗供应更容易获得，打击有害的错误信息和虚假信息，以及更好地促进世界各地的疫苗接种率，必须成为首要任务。
医学院副教授、流行病学家Brandon J. Brown
人们如何保护自己不受奥密克戎的影响？
目前我们对这种新的变体所知甚少，但有一点我们确实知道，面部遮盖物可以防止呼吸道病毒的传播，包括SARS-CoV-2。在这个国家，我们可以获得COVID-19疫苗，包括加强针，所以我们都应该接种这些疫苗以及年度流感疫苗，为许多专家认为将是一个困难的冬天做准备。许多接种了COVID-19疫苗的人在室内或室外的公共场所不再戴口罩，但是随着新的令人担忧的变体的出现，有口罩的安全要比没有口罩的遗憾好。
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研究提供了接种mRNA新冠疫苗后心脏炎症风险的更令人放心的数据
发表在《BMJ》上的一项新研究证实了之前关于接种BNT162b2（辉瑞-BioNTech公司）和mRNA-1273（Moderna）疫苗后心脏炎症（心肌炎或心包炎）风险增加的报告，但显示病例的绝对数量很低，甚至在年轻群体中也是如此。这为支持COVID-19的mRNA疫苗的整体安全性提供了进一步证据。
该报告称，在接种辉瑞-BioNTech疫苗后，年轻个体（12-39岁）每10万人中仅有1.6例心肌炎病例；研究结果支持COVID-19的mRNA疫苗的总体安全性。这项研究对接种COVID-19 mRNA疫苗后的心脏炎症（心肌炎或心包炎）风险提供了更令人放心的数据。
心肌炎（心肌的炎症）和心包炎（心外膜的炎症）是罕见但严重的疾病，通常由病毒、细菌或真菌感染引发。
最近的报告和研究表明，接种mRNA疫苗后，特别是第二剂后，心脏炎症的风险增加。但到目前为止，还没有研究使用完整人群的信息来调查这种关联。
为了解决这个问题，丹麦的研究人员利用国家医疗数据寻找mRNA疫苗接种与心肌炎或心包炎的医院诊断、血肌钙蛋白水平（心肌损伤的衡量标准）的增加以及住院时间超过24小时之间的联系。
他们的分析包括近500万名12岁或以上的丹麦居民，他们接受了辉瑞-BioNTech或Moderna疫苗。
参与者从2020年10月1日到2021年10月5日接受监测，并考虑了一系列潜在的影响因素，如年龄、性别、疫苗优先组和潜在健康状况。
在随访期间，269名参与者患上了心肌炎或心包炎，其中108人（40%）为12-39岁，196人（73%）为男性。
总的来说，结果显示，接种Moderna疫苗与心肌炎或心肌缺血之间有很强的关联，而接种辉瑞-BioNTech疫苗仅与女性心肌炎或心肌缺血率增加有关。
Moderna疫苗接种的心肌炎或心包炎发生率高于辉瑞-BioNTech疫苗接种。然而，两种疫苗接种后的绝对事件数量都很低，而且病例主要是轻微的。
例如，与未接种该疫苗的人相比，在3482295名接种辉瑞-BioNTech疫苗的人中，有48人在接种后28天内发生心肌炎或心包炎（绝对比率为1.4/100,000）。
在女性中，绝对比率为10万分之1.3，男性为10万分之1.5。在12-39岁的人群中，绝对比率为10万分之1.6，而在最年轻的年龄组（12-17岁）中，在接种辉瑞-BioNTech疫苗后的28天内，绝对比率仅为10万分之1。
与未接种的人相比，在498814名接种Moderna疫苗的人中，有21人在接种后28天内发生心肌炎或心包炎（绝对比率为10万分之4.2）。
在女性中，绝对比率为10万分之2，男性为10万分之6.3。在12-39岁的人群中，接种Moderna疫苗后28天内的绝对比率为10万分之5.7。
与未接种疫苗的人相比，这两种疫苗还与心脏骤停或死亡（心肌炎或心包炎的最严重表现）的风险减少约50%有关。
相比之下，与未感染的人相比，在COVID-19检测呈阳性后28天，心脏骤停或死亡的风险增加了14倍。
这是一项观察性研究，所以不能确定原因，研究人员指出了一些潜在的偏见来源，如公众对疫苗潜在副作用的认识提高，可能影响了结果。
然而，他们说这是一项精心设计的研究，基于完整人群的高质量医疗数据，而且在进行额外分析后，结果基本没有变化，这表明它们经得起推敲。
因此，研究人员得出结论：在丹麦人群中，使用Moderna和辉瑞-BioNTech的mRNA疫苗接种与心肌炎或心包炎的风险增加有关，但这两种疫苗接种后出现心脏炎症的绝对比率很低，甚至在年轻群体中也是如此。
他们补充说，在解释这些发现时应考虑到接种疫苗的好处，需要进行更大规模的多国研究，以进一步调查在较小群体中接种疫苗后发生心肌炎或心包炎的风险。
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研究：动物体内的病毒进化或能揭示COVID-19的未来
当动物从人类身上感染COVID-19时，新SARS-CoV-2变种可能会出现。为了评估这一现象，来自科罗拉达州立大学兽医和生物医学学院的一个跨学科小组系统地分析了猫、狗、雪貂和仓鼠感染后病毒中出现的变异类型。
在各种野生动物、动物园和家庭动物中确认的COVID-19病例显示了跨物种传播，这对大多数病毒来说是一种罕见的情况。
这项新研究的论文第一作者之一、微生物学、免疫学和病理学系博士生Laura Bashor指出：“SARS-CoV-2在冠状病毒的领域里具有非常广泛的物种范围。一般来说，许多类型的病毒不能感染其他物种的动物，它们进化得非常特殊。”
论文另一位第一作者、现在是宾夕法尼亚大学野生动物疾病生态学助理教授Erick Gagne则指出：“人类跟许多不同的动物有如此多的接触，这使得这种病毒有机会接触到各种不同的物种。”
该病毒的全球影响和溢出给了研究人员一个独特的机会来研究SARS-CoV-2的病毒进化。这些研究野生猫和家猫疾病传播的专家将他们在序列分析和研究基因组集合方面的经验应用于SARS-CoV-2。这项研究最近发表在美国国家科学院的官方杂志《PNAS》上。
新出现的突变
来自VandeWoude实验室的研究人员通过跟生物医学系的Angela Bosco-Lauth助理教授和Dick Bowen教授的合作利用了他们自己的动物模型专业知识开发了一种动物物种对SARS-CoV-2的敏感性测试。
研究结果的关键还在于对不同阶段的病毒进行了较新的测序技术。该技术现在常用于检测人类群体中的变体。微生物学、免疫学和病理学系副教授Mark Stenglein为该研究提供了分析生物分子序列的计算技能，即所谓的生物信息学。
“我们发现有进化，我们看到对病毒的选择，我们看到病毒的基因组序列中出现了很多变体，”Bashor说道。
为了给研究提供充足的病毒材料，Bosco-Lauth和Bowen在实验室培养的细胞中培养了一个SARS-CoV-2人类样本。Bashor和Gagne确定，在这一过程的每个步骤中都会出现多种突变并成为基因群体中更大的比例。
然后，他们将该病毒引入到四种家庭宠物并在感染后从它们的鼻腔中收集病毒样本。
“在动物身上，细胞培养的变体重新回到了最初的人类类型，这表明很可能在该细胞培养和环境中发生了适应性，进而被选择为这些变体，”Gagne说道。
细胞培养SARS-CoV-2变体中的这些突变并没有全部转移到新宿主身上。相反，在活体动物排出的病毒中出现了不同的变异。
该研究中的最初病毒样本是在2020年初分离出来的。在整个研究过程中，研究小组观察到了此后在人类群体中以加速的速度形成广泛的SARS-CoV-2毒株的突变。
“其中有一些是我们后来在人类中看到的阿尔法、贝塔、德尔塔变体，”论文高级作者Sue VandeWoude博士指出，“有一些特定的遗传密码变化模仿了其他科学家在人身上报告的情况。”
两只猫之间的接触表明SARS-CoV-2变体可以被传播并有可能在该物种内产生一个新的菌株。
“这也是我们在人身上看到的情况，”Bosco-Lauth说道，“真正适应支持SARS-CoV-2感染的宿主也非常善于让这些变异体坚持下去并被传递。”
未来
当Bashor在SARS-CoV-2大流行期间来到科罗拉多州立大学开始她的博士研究时，她并没有预料到会研究这个疾病。然而，这为她提供了一个独特的机会，让她作为一名研究生在疾病生态学和进化方面的一个非常酷、可行的项目上一展身手。
当团队启动SARS-CoV-2研究时，Gagne正在VandeWoude实验室完成他关于猫科动物逆转录病毒的跨物种传播的博士后研究。
VandeWoude方面表示，像Bashor和Gagne这样的研究生和早期职业科学家对SARS-CoV-2研究做出了有意义的贡献。
研究团队继续着他们的调查并将重点放在猫身上。而之所以把重点放在猫身上是因为它们对来自人类的COVID-19溢出表现出更高的易感性并能产生病毒的变种并传播给其他猫。
Bashor开始分析来自世界各地大量猫科物种的SARS-CoV-2基因组序列，其中包括老虎、狮子和雪豹。公开的受感染猫的数据可以提供更多关于COVID-19在猫科物种内部和之间的适应性和变异性的见解。
目前没有证据表明猫会传染给人类。但猫仍对人类群体中的COVID-19的所有变体易感。
通过了解猫体内的病毒进化，研究小组可能会找到问题--人类和动物的SARS-CoV-2的未来是什么--的答案。
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CDC的失败：调查发现第首批COVID-19试验中存在设计错误和样本污染问题
根据本周发表在《PLOS ONE》杂志上的一项CDC内部调查，由美国疾病控制和预防中心（CDC）分发的最早一批COVID-19测试表现出阴性对照的假阳性反应性，原因是检测设计的缺陷和其中一个检测组件的污染。
来自中国武汉一名患者的完整SARS-CoV-2基因组序列于2020年1月12日公布，CDC科学家开始快速开发实时RT-PCR诊断板，以检测这种新型冠状病毒。第一个RT-PCR小组从2020年2月5日开始向美国各州公共卫生实验室分发，旨在识别SARS-CoV-2基因组上的三个独特点，即我们日常所说的"位点"。
在分发的几天内，CDC收到了来自多个实验室的报告，称三个探针中的两个探针（被称为N1和N3）产生的阴性对照有假阳性反应。这导致了对样本的修改，包括删除N3探针。在近期的新研究中，CDC的研究人员审查了该诊断小组的设计、验证、制造和分配。研究小组得出结论，阴性对照的假阳性反应的一个来源是RT-PCR试剂盒的N1成分被一块合成的遗传物质污染。在分发的试剂盒的初始生产批次中检测到了N1污染，这导致了大约2%的假阳性，但验证前的材料没有被污染（0%的假阳性）。因此，研究人员确定，N1污染虽然后来得到了解决，但确实影响了生产后的质量控制过程或试剂盒产品。
同时，科学家们报告说，N3探针的阴性对照的假阳性反应是由于一个设计缺陷造成的。在没有任何病毒的情况下，N3探针中的两个分子经常相互结合，引发了预示阳性反应的荧光。阴性对照的这种假阳性反应性随着RT-PCR检测试剂盒的年龄增长而增加，这可以解释为什么使用新生产的材料进行的早期评估没有看到高水平的假阳性。
该小组说，阴性对照的假阳性反应问题后来导致了CDC对RT-PCR和其他诊断测试的质量控制、质量保证和检测验证的改进。这些变化包括由独立于诊断小组设计团队的专家进行审查和批准的额外步骤，以及在公共卫生实验室进行诊断小组试点，以确认功能和可用性。
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Novavax COVID-19疫苗在试验中被认为"高度有效且非常安全"
根据2021年12月15日发表在《新英格兰医学杂志》上的一项3期临床试验的结果，Novavax公司生产的一种研究性COVID-19疫苗在预防COVID-19疾病方面被发现有90%的有效性。马里兰大学医学院（UMSOM）的疫苗开发和全球健康中心作为试验地点之一，马里兰大学医学院儿科教授Karen Kotloff博士担任试验方案的联合主席。
在这项研究中，研究人员在美国的113个临床站点和墨西哥的6个站点招募了近3万名成年志愿者。大约2万名参与者接受了间隔三周的两剂疫苗，1万名接受了安慰剂。除了在预防任何严重程度的COVID疾病方面非常有效之外，该疫苗在预防需要住院的中度和重度疾病方面也是100%有效。
"我们的研究结果表明，这种疫苗非常有效，而且非常安全"。- 卡伦-科特洛夫，医学博士，UMSOM的儿科教授如此评价。
在2021年的头几个月，当研究在美国和墨西哥进行时，主要研究对象菌株还是Alpha，因此评估菌株不包括Delta或Omicron变种，因为它们那时还没有开始流行。
Novavax疫苗的大多数副作用是轻度到中度的，而且是暂时性的。发烧是非常罕见的。疫苗接种者最常见的副作用包括注射部位的疼痛和触痛、头痛、肌肉酸痛和疲劳，平均持续一天。没有一个接受者出现严重的反应，如心脏炎症（心肌炎）或血栓症状。
"我们的研究结果表明，这种疫苗具有很高的效力，而且非常安全。此外，这种疫苗有许多吸引人的特点。它是由一小块蛋白质制成的，就像美国目前许可的许多疫苗一样，只需要简单的冰箱储存要求，因此它将成为COVID-19疫苗组合的一个重要补充，尤其是在更多缺乏高级别冷链的国家。"Kotloff博士说。
UMSOM站点招募了近500名18岁以上的参与者。参与者在人口统计学上具有多样性，以反映普通人群中感染和患病风险最高的人群，包括受大流行病影响过大、代表性不足的少数民族群体。大约12%的研究参与者属于65岁以上的高危人群。在UMSOM的研究参与者中，约有27%的人是黑人，19%是西班牙裔，16%是亚裔，7%是美国印第安人或阿拉斯加土著。
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科学家发现新冠疫情新特点：近一半新冠病毒感染者没有症状
来自《美国医学会杂志》(JAMA)上的一项大规模研究显示，那些感染新冠病毒的患者中，10人中有4人是无症状感染者。这项大规模荟萃分析整理了95篇论文数据，数据主要来自欧洲、北美和亚洲，但也包括非洲和南美的数据，受试者超过2900万人。
结果发现，发现40.5%的新冠病毒感染者虽然病毒检测呈阳性，但是却没有症状，这意味着近一半患者都是无症状感染者。
此外，在所有受试人群中，无症状感染在39岁以下的年轻人中也更常见，可能是因为年轻人的身体素质更好。大多数无症状感染发生在欧洲，而亚洲的比例最低，这或与每个地区实行的检测制度有关。
在无症状感染者中，孕妇和乘飞机或邮轮的人群中最为常见。因此，对旅行者进行筛查和检测对于减少社区传播非常重要。
新冠病毒感染确诊病例中，有三分之一是医护人员或医院患者。因此，医院的防控措施十分重要，需加强检测以识别无症状感染者，并加强个人防护装备（PPE）和个人消毒。
研究人员表示，该研究结果表明，新冠病毒感染者中无症状感染者拥有者很高的比例，这也是造成社区传播的潜在风险，希望公众和政府能够看到这一点，并加强防疫措施以及个人防护。
据了解，无症状感染者是指无相关临床症状（如发热、咳嗽、咽痛等可自我感知或可临床识别的症状与体征），呼吸道等标本新冠病毒病原学（通常指核酸检测）或血清特异性免疫球蛋白M（IgM）抗体检测阳性者。
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生物学家：COVID-19将会发展成地方病
现在，5至11岁的孩子有资格接种COVID-19疫苗，美国完全接种的人数也在增加，许多人可能想知道COVID-19的结局是什么。在大流行的早期，期望SARS-CoV-2可能就这样消失也不是没有道理的，因为从历史上看，一些大流行的病毒就已经消失了。
比如SARS-CoV是导致2003年第一次SARS大流行的冠状病毒，从2002年11月到2003年7月扩散到29个国家和地区并感染了8000多人。但由于快速和有效的公共卫生干预措施，SARS-CoV在近20年里没有在人类身上观察到，现在则被认为已经灭绝。
而另一方面，大流行性病毒也可能逐渐沉淀为一个相对稳定的发生率并保持一个恒定的能向他人传播病毒的受感染宿主库。这些病毒被称为“地方病”。
在美国，地方病病毒的例子包括那些导致普通感冒和季节性流感的病毒，它们年复一年地出现。跟这些病毒一样，导致COVID-19的病毒很可能不会消亡，并且大多数专家现在预计它将成为地方病。
对此，来自科罗拉多大学博尔德分校的一个病毒学家和免疫学家团队对感染人类的动物病毒展开了研究，他们研究的一个基本重点是确定和描述动物病毒在人类群体中持续存在所需的关键适应性。
是什么决定了哪些病毒会流行？
那么为什么2003年的第一个SARS病毒(SARS-CoV)灭绝了，而心在这个病毒(SARS-CoV-2)却可能成为流行病？
一种病毒的最终命运取决于它如何维持其传播。一般来说，具有高度传染性的病毒即它们在一个人跟另一个人之间传播得非常好并可能永远不会自行消亡是因为它们非常善于寻找新的感染者。
当一种病毒第一次进入一个没有免疫力的人群时，它的传染性被科学家用一个简单的数学术语定义，叫做R0，也被称为传染数。一种病毒的繁殖数代表平均每个感染者会感染多少人。如第一个SARS-CoV的R0约为2，意味着每个受感染的人平均将病毒传给两个人。对于SARS-CoV-2的德尔塔变异株，其R0则在6到7之间。
公共卫生当局的目标是减缓病毒传播的速度。做好防护、保持社交距离、追踪接触者和做好隔离都是减少呼吸道病毒传播的有效工具。由于SARS-CoV的传播性很差，只需要一点点的公共卫生干预就可以将病毒赶尽杀绝。鉴于德尔塔变体的高度传播性，消除该病毒的挑战将更大，这意味着该病毒更有可能成为地方病。
COVID-19是否会消失？
很明显，SARS-CoV-2在寻找新的感染者方面非常成功并且人们在接种疫苗后也会被感染。由于这些原因，这种病毒的传播预计不会结束。重要的是，我们要考虑为什么SARS-CoV-2如此容易从一个人转移到另一个人以及人类行为如何在这种病毒传播中发挥作用。
SARS-CoV-2是一种通过空气传播的呼吸道病毒，当人们聚集在一起时就会有效传播。关键的公共卫生干预措施如口罩的使用和社交距离的保持一直是减缓疾病传播的关键。然而这些公共卫生措施的任何疏漏都可能产生可怕的后果。比如在大流行病的早期阶段，2020年的摩托车集会在南达科他州的斯特吉斯聚集了近50万人。大多数与会者都没有戴口罩也没有保持社交距离。这一事件直接导致了南达科他州和全美范围内COVID-19病例的增加。这表明当人们放松警惕时病毒就变得非常容易传播。
而导致COVID-19的病毒通常跟超级传播事件有关，即许多人同时被感染，通常是由一个受感染的人感染。事实上，研究人员的工作表明，仅2%的COVID-19感染者就携带了在社区中流通的90%的病毒。这些重要的“超级携带者”对感染其他人有不成比例的影响，如果在他们将病毒传播给下一个人之前没有被追踪到，那么他们将继续维持这种流行病。
最后，无症状感染者约占所有COVID-19感染者的一半。这一点，再加上人们被感染的时间范围很广--症状出现前两天和出现后10天，这为病毒传播提供了很多机会，因为不知道自己患病的人一般很少采取隔离措施。
SARS-CoV-2的传染性和高度相互关联的社会构成了一场完美的风暴，这将可能会促成病毒的持续传播。
我们跟COVID-19的未来会是什么样子？
研究人员指出，鉴于以上讨论的考虑以及我们迄今对COVID-19的了解，许多科学家认为，导致COVID-19的病毒很可能会进入地方病的传播模式，但无法根除该病毒并不意味着所有的希望都破灭了。
大流行后的未来将在很大程度上取决于该病毒在未来几年的演变情况。SARS-CoV-2是一种全新的人类病毒，仍在适应其新的宿主。随着时间的推移，我们可能会看到该病毒的致病性降低，类似于导致普通感冒的四种冠状病毒，它们只不过会变成一种季节性的困扰。
而全球疫苗接种计划将对遏制该疾病的新病例产生最大影响。然而，到目前为止，SARS-CoV-2疫苗运动只触及了地球上一小部分人。此外，由于没有一种疫苗是100%有效的，所以接种疫苗的人仍会发生突破性感染。这意味着可能需要进行加强针注射从而最大限度地提高疫苗诱导的感染保护。
随着全球病毒监测和安全有效疫苗的开发速度，我们已经准备好应对SARS-CoV-2这个不断变化的目标。流感是地方性的且演变得很快，但季节性疫苗接种却使得生活能正常进行。我们可以期待SARS-CoV-2的情况最终也能如此。
我们如何知道SARS-CoV-2是否以及何时会成为地方病？
四种季节性冠状病毒已经在人类中流行。它们往往每年都会复发，通常是在冬季，并且对儿童的影响要大于成人。导致COVID-19的病毒还没有稳定在这些可预测的模式中，而是以有时难以预测的方式在全球范围内不可预测地涌现。
一旦SARS-CoV-2的比率稳定下来，我们就可以称其为地方病。但这种转变可能会根据你在世界的位置而有所不同。比如疫苗覆盖率高的国家可能很快就会在冬季进入可预测的COVID-19高峰期，此时环境条件成为了病毒传播的更重要的原因。相反，在疫苗接种率较低的地区，不可预测的流行病可能会持续存在。
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新研究发现Moderna疫苗对所有SARS-CoV-2病毒变种"高度有效"
（2021年12月15日）发表在《英国医学杂志》上的Kaiser Permanente研究显示，2剂Moderna COVID-19疫苗对所有SARS-CoV-2变种都非常有效；然而，随着接种后时间的增加，对delta变种的疫苗效力适度下降。
"我们之前进行的一项研究显示，两剂量Moderna COVID-19疫苗的有效性很高，但随着2021年初夏Delta变种成为主流，这对变种的有效性产生了疑问，"该研究的主要作者，Katia Bruxvoort博士说，他是Kaiser Permanente南加州研究与评估部的兼职调查员。
"这项研究证实了在研究期间对所有变种的有效性，尽管我们确实发现随着时间的推移，对Delta感染的有效性有所下降，从接种疫苗后头两个月的94%的有效性下降到6个月后的80%。对Delta变种引起的住院治疗的保护效果仍然很高，达到98%。"
在南加州的Kaiser Permanente对要求进行SARS-CoV-2的分子诊断测试的会员是免费的，不管他们是否有COVID-19的症状。在入院和许多医疗程序之前也会进行检测。从2021年3月开始，南加州的Kaiser Permanente开始将有症状和无症状的人的SARS-CoV-2阳性标本送到一个签约实验室进行全基因组测序。
这项由Moderna资助的研究包括8153名SARS-CoV-2检测阳性的人，标本采集于2021年3月1日至7月27日。其中，91.3%的人未接种疫苗，1.4%的人接种过1剂Moderna COVID-19疫苗，7.3%的人接种过2剂Moderna COVID-19疫苗。
在这些样本中，有5186个样本被确定为变种；39.4%为Delta，27.7%为Alpha，11.4%为Epsilon，6.9%为Gamma，2.2%为Iota，1.4%为Mu，以及11.1%为其他变种。在进行这项研究时，南加州地区还没有检测到Omicron变种。
研究人员将检测结果为阳性的人与检测结果为阴性的人进行了比较，结果发现：
两剂量的Moderna COVID-19疫苗对各变种的感染效果：
Delta：86.7%
Mu：90.4%
Alpha：98.4%
其他确定的变种：96%至98%。
接种两剂Moderna COVID-19疫苗的人，对与Delta变异体有关的COVID-19住院有很强的保护作用，且疫苗对Delta感染病例住院的有效性高达97.5%。由于在接种者中没有发现非Delta变异体的住院情况，因此没有估计非Delta变异体的疫苗效力。
令人鼓舞的是，在接种了2剂Moderna COVID-19疫苗的人群中，没有发生住院死亡。在18至64岁的人群中，2剂Moderna COVID-19疫苗对delta感染的疫苗有效性为87.9%，在65岁及以上人群中为75.2%。
该研究的高级作者、Kaiser Permanente南加州研究与评估部的研究员Hung Fu Tseng博士说："虽然这项研究提供了令人放心的证据，证明2剂Moderna COVID-19疫苗在预防COVID-19感染和因包括delta在内的变种而住院方面的有效性，但它也对加强注射有影响。随着时间的推移，Moderna COVID-19疫苗对delta感染的有效性适度降低，这一发现支持目前的加强剂量建议"。
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