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小型研究：感染COVID-19后出现的脑雾与脊髓液中的免疫异常有关
研究：突破性COVID-19感染产生了强烈的抗体反应
传闻新冠或永久损伤男性性功能 曾光教授：没有证据
研究人员就人们对奥密克戎变异株提出的一些紧迫问题进行解答
CDC新研究显示第三剂新冠疫苗对预防奥密克戎重症和死亡至关重要
三项大型研究显示COVID-19疫苗加强针能更有效对抗奥密克戎感染
美FDA：瑞德西韦现在可以作为COVID-19门诊治疗药物
科学家公布世界首个新冠Omicron变体刺突蛋白的分子水平分析结果
研究：辉瑞新冠疫苗跟患心肌炎风险增加有关 但发生概率极低
24小时确诊近80万：美国疫情数据地图几乎全紫了
科学家确定COVID-19再感染的免疫标记 防御危险新变种时至关重要
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小型研究：感染COVID-19后出现的脑雾与脊髓液中的免疫异常有关
一项小型研究建立在越来越多的证据之上，这些证据表明，长病程COVID症状可能与免疫系统的异常活动有关。这项新研究发现，在感染COVID-19轻症之后的几个月里，一些经历持续脑雾的患者的脑脊液中出现了意想不到的炎症标记。
LIINC（新型冠状病毒感染的长期影响）是由加州大学旧金山分校的研究人员领导的一个的项目，研究COVID-19在急性感染后几个月和几年内对病人的影响。这个项目的最新研究是对出现脑雾的长期COVID患者的脑脊液生物标志物的异常调查。
这项小而彻底的研究从17名受试者身上采集了脑脊髓液（CSF）样本。所有队列中的人都在10个月左右经历了COVID-19的轻症。13名受试者出现了持续的脑雾迹象，而其余4名受试者作为对照，没有COVID后的认知问题。
虽然在对照组中没有检测到CSF异常，但那些经历持续脑雾的人中有77%（13人中有10人）出现了一些意想不到的异常情况。这些异常包括表明存在神经炎症的蛋白质水平升高和不寻常的免疫抗体量。
这项新研究的资深作者Joanna Hellmuth说，在病毒大概被清除的几个月后，免疫活动升高的迹象表明，与长病程COVID有关的认知问题可能与挥之不去的炎症有关。
Hellmuth说：“有可能免疫系统在病毒的刺激下，可能以一种非预期的病理方式运作。即使这些人的身体里没有病毒，也会出现这种情况。”
有趣的是，那些报告在感染COVID后出现持续的认知问题的人中，有近一半表示他们的认知症状延迟出现。这种报告的脑雾直到43%的受试者出现第一个COVID症状后一个月才出现，29%的受试者报告他们的认知问题直到初始症状后两个月才出现。
“报告认知PASC（SARS-CoV-2急性期后遗症）延迟出现的参与者比例很大，这意味着SARS-CoV-2感染急性期后发生的事件可能有助于发病机制并对早期干预作出反应，”作者在研究中写道。“可能延迟发病的机制包括微血管损伤、持续的免疫激活和感染后的自身免疫反应。”
最近的几项研究指出了长病程COVID患者的免疫功能紊乱。最近，《自然-免疫学》杂志上的一项研究全面描述了基于血液的免疫生物标志物模式，描述了大多数长COVID患者在急性病后八个月内的特征。另一项由耶鲁大学的研究人员领导的强有力的最新研究，证明了SARS-CoV-2如何直接感染脑细胞。
据Hellmuth说，长期的认知问题与几种病毒感染有关，包括艾滋病毒和其他冠状病毒。因此，假设感染SARS-CoV-2会导致挥之不去的认知问题是合理的，而且这些长病程COVID症状可以在经历了轻症的病人身上看到。
“如果人们告诉我们他们有新的思维和记忆问题，我认为我们应该相信他们，而不是要求他们满足某些严重性标准，”Hellmuth说。
这项新研究发表在《临床与转化神经病学年鉴》杂志上。
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/acn3.51498
02
研究：突破性COVID-19感染产生了强烈的抗体反应
最近的一项研究考察了接种COVID-19疫苗的人因突破性感染产生的中和抗体反应的强度、持久性和广度。该研究结果本周发表在《细胞》上。华盛顿大学生物化学系的Alexandra Walls和David Veesler领导了该项目。
值得关注的Delta和Omicron冠状病毒变体的特征包括：与原始病毒相比，其具有更强的传播性和免疫规避能力。这些特点，以及疫苗免疫力的减弱，已经导致接种疫苗的人出现突破性感染。在大多数情况下，接种SARS-CoV-2疫苗的其他健康人如果最终感染了病毒，通常不会有严重的症状。
研究人员想了解接种疫苗后感染病毒对中和抗体有什么影响，并看看这些反应有多持久和广泛。他们希望推进这些知识将有助于指导疫苗接种政策和大流行病缓解策略。
通过他们的项目，研究人员了解到，抗体反应的程度取决于一个人是否通过感染、接种疫苗或两者的混合而对刺突蛋白有过一次、两次、三次或四次接触。科学家们还检查了在感染 COVID-19 后接种过疫苗的人群、之前接种过疫苗并经历过突破性感染的人群、仅接种过疫苗的人群以及接种了三剂疫苗的人群的抗体反应。
在他们的研究对象中，那些完成了三剂疫苗接种方案的人，以及那些从COVID-19中恢复后接种疫苗的人，和那些在接种疫苗后出现突破性感染的人，在规模和广度上启动了几乎相当的中和抗体反应。他们对当前大流行冠状病毒变体中的刺突蛋白的血清结合和抗体中和反应比那些只接种过两剂COVID-19疫苗的人或以前没有接种过疫苗的人所产生的反应要强得多、且更持久。
这一观察表明，通过感染和接种疫苗或三剂疫苗，增加对SARS-CoV-2抗原的接触次数，提高了抗体反应的质量。
研究人员还观察了所激发的抗体可能有多广泛。他们研究了Omicron SARS-CoV-2变体的中和作用，该变体目前对美国的大多数病例负责。他们的研究结果显示，接种加强针的个体的中和抗体水平与针对原始毒株接种两次的受试者相似。这表明有大量的免疫规避，但疫苗加强针可以帮助缩小Omicron造成的中和抗体差距。
从SARS-CoV-2家族以外的地方看，也有类似的模式，即重复和多次接触可以改善原本对SARS-CoV的弱中和抗体反应。最后，作者没有发现对普通感冒引起的冠状病毒刺突蛋白如OC43或HKU1的抗体结合有所改善。这表明，反复接触SARS-CoV-2并不能改善对更多不同的冠状病毒的刺突反应性。这些发现支持开发更广泛的sarbecovirus病毒或冠状病毒疫苗，以便在未来发生溢出事件时做好准备。
研究小组由大约15人组成，来自西雅图华盛顿大学的住院或非住院成人呼吸道病毒感染项目，即HAARVI。HAARVI由华大医学部传染病医生Helen Chu领导，研究恢复的COVID-19患者，以研究长期的免疫反应，了解感染的长期后果，并比较疫苗和自然感染的免疫反应。
https://www.cell.com/cell/pdf/S0092-8674(22)00069-1.pdf?_returnURL=https%3A%2F%2Flinkinghub.elsevier.com%2Fretrieve%2Fpii%2FS0092867422000691%3Fshowall%3Dtrue
03
传闻新冠或永久损伤男性性功能 曾光教授：没有证据
前不久，关于“新冠或永久损伤男性性功能”的话题引发了广泛关注，甚至一度登顶各平台热搜。据澎湃援引俄罗斯卫星通讯社报道，英国伦敦大学学院近期一项研究显示，近5%的成年男性在感染新冠病毒后出现了睾丸和阴茎体积减小的情况，还有15%的人反映经历了勃起功能丧失。
比如此前就有一位美国男子在参加节目时表示，在感染新冠病毒后，他的阴茎缩水了1.5英寸（约合3.8厘米）还出现了勃起障碍问题。
虽然经过治疗之后，病情得到了好转，但长度由于新冠病毒造成的血管损伤，似乎受到了永久性影响。
《世界男性健康杂志》上的一项研究解释，新冠病毒感染导致的血管功能障碍或内皮功能障碍可能会导致勃起功能障碍（ED）。内皮功能障碍表现为小血管内膜无法正常发挥所有功能，因此会阻碍组织供血。
对于此事引发的热议，卫健委曾光教授也出面进行了回应，他表示：“没有的事，现在没有证据证明，只是极少概率发生的事，没有普遍意义。”
曾光教授还强调，抽烟对此带来的伤害要比新冠后遗症要严重的多，“新冠这事还没有呢，就为这紧张起来了，没有道理。”
所以，大家大可不必对这种没有被证实的因果关系而困扰，日常防疫做好个人防护即可。
04
研究人员就人们对奥密克戎变异株提出的一些紧迫问题进行解答
SARS-CoV-2的奥密克戎变异株，即引起COVID-19的病毒，已经助长了全球病例的迅速激增。日前科罗拉多大学博尔德分校的一个病毒学家和免疫学家团队就人们对这个新变种提出的一些紧迫问题进行了评估。
奥密克戎与以前的变种有什么不同？
奥密克戎与2019年底出现的SARS-CoV-2病毒以前的变种有两个关键区别。早期数据表明，奥密克戎感染病例比德尔塔变体引起的感染更温和。从另一个角度看，奥密克戎的传播性要比以前的变体强得多--这意味着它更容易传播。思考一个较温和的病毒的整体影响可能会让人困惑，因为它的传染性也要强得多。
2021年夏天，当德尔塔变体成为主导并取代阿尔法变体时，它之所以能够做到这一点，是因为它的传播性高出40%至60%。现在，奥密克戎变体的传播性甚至比德尔塔更强。
研究人员认为，很难用数字来衡量一个变体比另一个变体的内在传播性，因为人类行为和疫苗接种比例一直在变化。这些因素，再加上传播性，影响了病毒在人群中的表现。
与SARS-CoV-2的原始毒株相比，奥密克戎在其整个基因组中包含72个突变。这些突变中的一些导致了这一变体的复杂的新特征。这些变化中有一半是在刺突蛋白中，这是一种关键的表面蛋白，使病毒能够抓住并感染细胞。这也是被人类免疫系统识别的关键病毒特征。
为什么奥密克戎的传播如此迅速？
初步研究表明，与早期变种相比，奥密克戎在上呼吸道（包括鼻子、喉咙和嘴）中的繁殖更有效，使其与普通感冒病毒更相似。如果这些初步研究的数据成立，那么它可能有助于解释奥密克戎的高传播性。在上呼吸道复制的病毒可能更容易传播，尽管这其中的原因还不完全清楚。
此外，奥密克戎通常能够逃避现有的免疫力，足以开始感染，引起症状并传播给下一个人。这就解释了为什么再感染和疫苗突破性感染似乎在奥密克戎中更为常见。
这些特性，以及这个变种在假日季节出现的时机，导致了美国COVID-19感染的异常激增，再加上冬季使人们更多地待在室内--以及“大流行倦怠”，就有了快速传播的“完美风暴”。
好消息是，尽管如此，疫苗接种和疫苗增强剂仍能提供良好的保护，防止严重疾病和住院治疗。但是考虑到目前的病例数量，这仍然意味着在未来几周会有大量的疾病、住院和死亡。
奥密克戎能否使人口更接近群体免疫？
当足够多的人对一种病毒有免疫力，以至于它不再能很好地传播时，就会发生群体免疫。只有在满足两个条件的情况下才有可能。首先，很大一部分人口必须接种疫苗或从以前的感染中恢复过来。其次，疫苗接种或先前的感染必须赋予足够的免疫力，以阻止或减缓未来的感染。疫苗接种运动，加上广泛的奥密克戎感染，是否足以带来群体免疫？
有三个问题使在奥密克戎之后实现长期群体免疫的希望变得复杂。首先是免疫力会随着时间的推移而自然减弱，不管它是来自于疫苗还是先前的感染。由于SARS-CoV-2感染人类只有两年时间，目前还不清楚感染或接种疫苗后对这种病毒的免疫力能持续多久。最终，对照研究将能够确定这一点。
第二，一些儿童还没有资格接种COVID-19疫苗，而且每天都有新的易感儿童出生。因此，在所有年龄段的儿童都有资格接种疫苗之前，可能会在儿童中持续传播。
第三，研究人员认为，不能排除新的变体可能逃脱现有的免疫力。正如奥密克戎所显示的，感染一个变体并不能保证对未来变体的感染有保护作用。
这三个因素加在一起表明，即使有足够大的一部分人从奥密克戎感染中恢复过来，长期的群体免疫力也是不可能的。这些也是人类从未对流感实现长期群体免疫，每年必须接种新流感疫苗的原因。
重要的是要记住，在迄今为止的所有变种中，因COVID-19住院的大多数人都没有接种疫苗。这表明，疫苗是降低疾病严重程度的有效工具，甚至对新变种也有好处。
像奥密克戎这样的新变体从何而来？
当病毒在人体细胞内复制更多自己的时候，它们在这个过程中会突变--改变它们的遗传密码。这些突变中的大多数不会对病毒有利。然而，在某些情况下，一个病毒中了一个或多个有益突变的“大奖”，从而推动了它在人群中的传播。阿尔法变体在刺突蛋白中拥有一些突变，使病毒更容易感染细胞。德尔塔变体有额外的突变，改善了病毒的传播。奥密克戎突变的数量惊人，是一个真正的怪异现象。一种冠状病毒在其基因组中迅速积累如此多的突变是罕见的。
人们对奥密克戎的起源仍然知之甚少。一个普遍的理论是，一个免疫力低下的人长期感染冠状病毒，导致病毒加速进化。另一种理论推测，奥密克戎可能已经在另一个动物物种中进化，然后重新感染了人类。另外，奥密克戎可能是在一个测序监控不佳的地方逐渐进化的。关于导致这种高度突变的变体出现的因素，仍有许多东西需要了解。
奥密克戎会不会变异得更加致命？
关于病毒的进化，最重要的一点是，自然选择有利于那些比其他变体更容易传播的变体。好消息是，更多的致病性--或危险的--变体不太可能很好地传播。这是因为感到特别难受的人往往会自然地自我隔离，减少病毒的传播机会。
还有一个好消息是，由于感染了一个变种，对其他变种提供了部分免疫力，奥密克戎的迅速传播带来了德尔塔感染病例的迅速下降。在这一点上，预计所有广泛传播的新变体--所谓的关注变体--将继续具有高传播性。
“deltacron”和“flurona”的情况如何？
2022年1月初，塞浦路斯的研究人员报告了COVID-19的感染病例，其中包含奥密克戎和德尔塔的序列，被称为"deltacron"。然而，其他科学家推测，这只不过是一种实验室污染物--被德尔塔变体污染的奥密克戎样本。虽然需要更多的细节，但就目前而言，没有理由对这种可能的混合体感到恐慌，因为它并没有被普遍观察到。
而在最近几周，“flurona”一词开始出现，指的是同时感染了流感病毒和冠状病毒的人。虽然很少见，但这种情况确实发生了。研究人员认为，重要的是人们要同时接种流感和COVID-19疫苗，以降低感染风险。但重要的是要注意，flurona 并不是流感和冠状病毒基因组的新组合，因此这个术语有点用词不当。
05
CDC新研究显示第三剂新冠疫苗对预防奥密克戎重症和死亡至关重要
美国疾病控制与预防中心（CDC）的三项新研究首次提供了关于第三剂COVID-19疫苗对快速传播的SARS-CoV-2的奥密克戎变体的有效性的真实世界的见解。该研究证实，第三剂疫苗能显著恢复对奥密克戎变体的感染和住院保护。
在不到三个月的时间里，被称为奥密克戎的SARS-CoV-2变体已经扩散到全球几乎每个角落。虽然南非的早期数据提供了一些关于这种新变体如何突破预先存在的疫苗诱导的免疫力的见解，但直到现在，研究人员才清楚地了解到，面对奥密克戎，第三剂COVID-19疫苗有多重要。
CDC的第一项新研究追踪了2021年8月至2022年1月初与COVID-19相关的住院和急诊情况，并比较了德尔塔和奥密克戎感染浪潮期间的两剂和三剂疫苗的有效性。
数据清楚地说明，与德尔塔相比，两剂mRNA疫苗对奥密克戎的严重疾病的保护作用明显不足。然而，第三剂明显增加了对这两种变体的保护。
在两剂mRNA疫苗的六个月后，数据显示该疫苗在预防德尔塔感染的急诊室和紧急护理就诊方面仍有76%的有效性。但在面对奥密克戎时，这种保护下降到38%。好消息是，第三剂mRNA疫苗将对奥密克戎的保护提高到了82%。
与德尔塔相比，两剂疫苗对奥密克戎的住院保护同样很低（81% vs 57%）。但同样地，第三剂量对这两个变体的保护效果提高到90%以上。
第二项研究考察了2021年4月至该年年底的COVID-19感染和死亡情况。在德尔塔感染浪潮的高峰期，该研究发现，与接种两剂疫苗的人相比，未接种疫苗者的COVID-19死亡风险高12倍；与接种三剂疫苗的人相比，未接种疫苗者的死亡风险高53倍。
研究发现，与两剂疫苗相比，第三剂疫苗能显著降低一个人感染奥密克戎的机会。虽然两剂疫苗后对奥密克戎死亡的保护仍然很强，但第三剂疫苗对COVID死亡的保护高达98%。
“在美国25个地区，当2021年12月出现奥密克戎变体时，观察到未接种疫苗者与完全接种疫苗者的病例发生率比率下降，以及未接种加强针疫苗者的病例发生率比率下降，”该研究得出结论。
发表在《美国医学会杂志》上的最后一项研究，归纳了2021年12月初至2022年1月初一个月内记录的7万个有症状的COVID病例。研究结果显示，与接受两剂疫苗的人相比，接受三剂疫苗的人发生有症状的奥密克戎感染的可能性低66%。
研究指出，那些接种第二剂疫苗超过6个月的人与那些未接种疫苗的人一样有可能发展成有症状的奥密克戎感染。当然，与未接种疫苗的人相比，两剂组群的疾病严重程度明显下降。
该研究还指出，证据表明，与接种两剂疫苗后出现突破性感染相比，一个人在接种三剂疫苗后出现突破性的奥密克戎感染，其传染性可能要小得多。
目前CDC的指导方针建议所有12岁以上的美国人在接种第二剂疫苗5个月后应该接受第三剂COVID-19疫苗。有资格接种第三剂疫苗的美国人中，只有不到一半的人接受了免费注射。CDC主任Rochelle Walensky在一次新闻发布会上说，这个新数据肯定了每个符合条件的人都需要接种第三剂疫苗。
Walensky说：“这些报告为及时接种COVID疫苗的重要性提供了更多证据--这意味着接种最初系列疫苗，并在符合条件时进行加强针接种，以防止严重的COVID 19。”
在新闻发布会上，Walensky明显不愿意预示“完全接种”的定义会转变为需要第三针。相反，她说CDC将 “调整”其围绕COVID疫苗接种的语言。
Walensky说："如果你有资格获得加强针，但你还没有接种它，你需要获得加强针，以达到最新的目的。我们真正在努力做的是透视语言，以确保每个人的COVID-19疫苗都是他们个人可以做到的最新的。"
早在2021年9月，美国国家过敏和传染病研究所所长安东尼-福奇就提出，mRNA COVID-19疫苗可能需要三剂才能完全有效。去年，在谈到为什么从两剂到三剂的转变可能是必要的时，福奇解释说，在大流行病的背景下，最紧迫的需求是拯救生命。这就是为什么2021年“完全接种”的定义只依赖于相隔几周的两剂疫苗，但是向前看，福奇说三剂疫苗可能将是有效接种的标准方案。
“从一开始就应该是一个适当的--三剂，”福奇去年说。“而我们没有立即知道的原因是我们正在处理这样一个紧急情况，我们需要证明疫苗是有效和安全的，而我们在两剂的情况下做到了。而且我们需要实施这种做法来拯救生命，我们已经做到了，可能已经拯救了数百万人的生命。”
两项新的CDC研究可以在这里找到。第三项新研究发表在《美国医学会杂志》上。
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三项大型研究显示COVID-19疫苗加强针能更有效对抗奥密克戎感染
据美联社报道，上周五发布的三项研究提供了更多的证据，表明COVID-19疫苗能够更有效抵抗奥密克戎变体，至少在接受过加强针注射的人群中是这样。
卫生官员说，这些研究是美国第一批研究疫苗对奥密克戎的保护的大型研究。这些论文呼应了以前的研究--包括在德国、南非和英国的研究--表明现有的疫苗对奥密克戎的有效性降低，但也表明加强针能增加对抗病毒的抗体，以增加避免症状性感染的机会。
第一项研究调查了从8月到本月美国10个州的住院、急诊室和紧急护理中心的访问情况。研究发现，在预防与COVID-19相关的急诊室和紧急护理就诊方面，辉瑞公司或Moderna公司的三剂疫苗效果最好。保护率从德尔塔感染浪潮期间的94%下降到奥密克戎感染浪潮期间的82%。仅仅两剂疫苗的保护率更低，特别是如果自接种第二剂疫苗以来已经过去六个月。官员们强调了不仅要预防感染，而且要预防严重疾病的目标。在这一点上，有一些好消息。该研究还发现，第三剂量对预防COVID-19的住院治疗至少有90%的有效性，无论是在德尔塔感染浪潮期间还是奥密克戎感染浪潮期间。
第二项研究侧重于25个州的COVID-19病例和死亡率，从4月初到圣诞节。接种加强针的人对冠状病毒感染有最高的保护，无论是在德尔塔占主导地位的时期还是在奥密克戎占主导地位的时期。
《美国医学协会杂志》发表了第三项研究，也是由CDC研究人员领导的。该研究调查了12月10日至1月1日在全美4600多个检测点进行的COVID-19检测阳性的人。与未接种疫苗的人相比，三针辉瑞和Moderna疫苗对奥密克戎相关的症状性疾病有大约67%的有效性。然而，研究人员发现，在完成原始系列疫苗的几个月后测量时，两针疫苗没有提供对奥密克戎的显著保护。
07
美FDA：瑞德西韦现在可以作为COVID-19门诊治疗药物
美国食品和药物管理局（FDA）已经宣布扩大瑞德西韦（Remdesivir）的治疗范围。有了这一变化，某些患上轻度或中度COVID-19的人--但没有住院的人--可以接受该药物的输注。FDA表示，其目的是为了防止这些人最终住院治疗。
Remdesivir，也被称为Veklury，到目前为止，只限于COVID-19疾病住院患者使用。这种通过静脉输液的抗病毒药物有助于防止COVID-19发展到严重状态。鉴于Omicron变体和创纪录的住院人数，FDA已经扩大了remdesivir的使用范围，包括一些已经感染了该疾病，但没有住院的人。
在一份关于该机构决定的声明中，FDA药物评估和研究中心主任Patrizia Cavazzoni博士说：“在FDA最近授权使用两种口服抗病毒药物之后，今天的行动加强了治疗COVID-19和应对Omicron变体激增的治疗库。”
Remdesivir已被批准用于治疗COVID-19患者；这次扩展使那些COVID-19检测呈阳性，出现轻度或中度感染，但没有因该疾病住院的人也可以使用该治疗药物。
据该机构称，这一扩展涵盖了12岁及以上、体重至少为88磅的人，该机构指出，这一变化是针对那些发展为严重感染的高风险人群。除此之外，将remdesivir作为COVID-19治疗药物用于12岁以下儿童的EUA也已扩大。
EUA的扩大涵盖了尚未住院的高风险患者，假设他们的体重在7.7磅至88磅以下。同样，该扩展允许治疗12岁以下的孩子，只要他们的体重不低于7.7磅--同样，如果他们被认为有住院和死亡的高风险。
该机构指出，给儿科病人的剂量将根据体重进行调整。此外，FDA警告说remdesivir不能替代接种疫苗--疫苗，包括加强针，仍然是防止COVID-19感染的最佳保护手段。
08
科学家公布世界首个新冠Omicron变体刺突蛋白的分子水平分析结果
不列颠哥伦比亚大学（UBC）医学院的研究人员对奥密克戎（Omicron）变体刺突蛋白进行了世界上第一个分子水平的结构分析。这些发现于2022年1月20日发表在《科学》杂志上。
该分析使用低温电子显微镜以接近原子的分辨率进行，揭示了严重变异的Omicron变体如何附着和感染人类细胞。
研究主要作者、UBC生物化学和分子生物学系教授Sriram Subramaniam博士说：“了解病毒刺突蛋白的分子结构很重要，因为它将使我们在未来开发出针对Omicron和相关变体的更有效的治疗方法。通过分析该病毒感染人体细胞的机制，我们可以开发出更好的治疗方法，破坏这一过程并中和病毒。”
位于冠状病毒外部的刺突蛋白使SARS-CoV-2能够进入人类细胞。Omicron变体在其刺突蛋白上有史无前例的37个突变，比以前的变体多三到五倍。
结构分析显示，几个突变（R493、S496和R498）在刺突蛋白和称为ACE2的人类细胞受体之间产生了新的盐桥和氢键。研究人员得出结论，这些新的键似乎增加了结合亲和力--病毒如何强烈地附着在人体细胞上--而其他突变（K417N）减少了这种键的强度。
Subramaniam博士说：“总的来说，研究结果表明Omicron比原始病毒具有更大的结合亲和力，其水平与我们在Delta变体中看到的更相近。尽管发生了如此广泛的变异，Omicron变体仍能保持其与人类细胞结合的能力，这一点非常了不起。”
研究人员进行了进一步的实验，显示Omicron刺突蛋白表现出更多的抗体规避。与以前的变体相比，Omicron显示出对所有六个测试的单克隆抗体的可测量的规避，其中五个完全逃脱。该变体还显示出对从接种过疫苗的人和未接种过疫苗的COVID-19患者身上收集的抗体的逃避能力增强。
"值得注意的是，与未接种疫苗的患者的自然感染免疫力相比，Omicron对疫苗产生的免疫力回避较少。这表明接种疫苗仍然是我们最好的防御手段，"Subramaniam博士说。
基于观察到的结合亲和力和抗体规避的增加，研究人员说，刺突蛋白突变可能是导致Omicron变体传播性增加的因素。
接下来，Subramaniam博士说他的研究团队将利用这一知识来支持开发更有效的治疗方法。
“我们团队的一个重要焦点是更好地了解中和抗体和治疗方法的结合，这些抗体和治疗方法将在整个变体范围内有效，以及如何利用这些方法开发抗变体治疗方法。”
https://www.science.org/doi/10.1126/science.abn7760
09
研究：辉瑞新冠疫苗跟患心肌炎风险增加有关 但发生概率极低
一项新研究发现，尽管绝对风险较低，但跟BNT162b2（俗称辉瑞/BioNTech疫苗）疫苗接种相关的心肌炎的相对风险还是存在增加的情况。考虑到青少年在接种第二针后风险明显增加，疫苗接种策略可能需要不断考虑不同亚人群的风险和益处，而不是采取“一刀切”的做法。
该研究结果将于当地时间2022年1月24日发表在《Annals of Internal Medicine》上。
心肌炎是一种罕见的心脏炎症，通常由细菌、病毒和寄生虫感染引起。心肌炎的常见亚型包括心肌炎（心肌的一种炎症）和心包炎（心脏外膜的一种炎症）。全球范围内都有关于接种BNT162b2疫苗后发生心脏炎的案例报告。一些研究还报告了类似的发现，但对这种推测性关联的分析研究是有限的。
来自中国香港大学的研究人员研究了160名病例患者（患有心脏炎）和1533名对照患者（没有心脏炎）以研究跟BNT162b2接种相关的心脏炎的潜在风险。根据年龄、性别和入院日期，10名对照患者与病例患者进行了匹配。
研究人员在进行分析后发现了20例心肌炎跟BNT162b2有关。接种BNT162b2的病人发生心脏炎的可能性是未接种疫苗的病人的3倍。
研究人员还观察到，跟BNT162b2有关的风险增加在男性中占主导地位且更有可能在注射第二剂之后出现。
接种后心肌炎的累积发病率为每10万剂0.57，这表明接种后心肌炎的绝对风险非常低。
研究人员称，在观察期内，接种BNT162b2疫苗后患心肌炎的20名病例患者中没有一人被送入ICU或死亡，而未接种疫苗的133名患者中有14人被送入ICU，12人死亡。
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24小时确诊近80万：美国疫情数据地图几乎全紫了
随着奥密克戎变异株在全球继续肆虐，整体疫情形势愈发严峻，全球累计确诊病例已经逼近3.5亿。去年的时候，美国疫情地图就几乎全红了，85.35％的县市成为高传播地区，覆盖美国人口的98％。
根据外媒公布的最新美国疫情地图，紫色已经覆盖了美国的绝大部分区域，这也是美国疫情形势的最深颜色——从浅到深分别是黄色、橘色、红色、紫色。
一位来自阿拉斯加的美国网友质问，不知道紫色之后会用什么颜色代表更高等级的疫情形势，在当地已经是近乎黑色的深紫色。
数据显示，截至美国东部时间1月24日下午6时20分，全美共报告新冠肺炎确诊病例71489205例、死亡病例868123例，而在过去的24小时内，美国新增确诊789789例、新增死亡1583例。
就在这种紧急情况下，仍然有大量的美国人拒绝配戴口罩、接种疫苗，甚至有56％的美国人已经不再相信CDC(美国疾控中心)发布的疫情信息。
美国国家过敏症和传染病研究所所长福奇此前表示，在美国，“所有人”都可能感染奥密克戎毒株。
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研究发现来自新冠康复患者的抗体可大大降低疾病的严重程度
新加坡国立大学的一项研究发现，一种名为P36-5D2的抗体显示了肺部和大脑中传染性病毒负荷的大幅下降，并减少了实验室模型的肺部疾病。
在新加坡国立大学林永禄医学院的生物安全三级（BSL-3）核心设施和清华大学联合进行的一项研究中，科学家们发现一种抗体能够中和令人担忧的主要SARS-CoV-2变种。
随着SARS-CoV-2变种的不断出现和在世界各地的传播，迫切需要赋予其广泛而有力的中和活性的抗体和疫苗。这篇题为"针对SARS-CoV-2变体的强效和保护性人类中和抗体"的论文首次发表在2021年12月的《免疫学前沿》上，解释了该团队如何从感染SARS-CoV-2的个人身上分离和鉴定单克隆抗体。
在这项研究中，晶体和电子低温显微镜结构分析显示，P36-5D2在针对刺突蛋白受体结合域上的保守表位时，经受住了三个关键突变。这些突变，即K417N、E484K和N501Y，在逃避许多强效中和单克隆抗体的变体中发现。作为预防性治疗的单次腹腔注射 P36-5D2 证明了在感染 SARS-CoV-2 Alpha 和 Beta 变体的过程中可以保护体内模型免受严重疾病的影响。这些模型具有正常的活动和体重，在长达14天的时间里没有出现与感染有关的死亡，并显示肺部和大脑中的感染性病毒大幅减少，肺部疾病也有所减少。
P36-5D2的效果为开发针对SARS-CoV-2及其现有和新出现的变种的抗体疗法提供了重要参考。该团队正在进行进一步的研究，以研究其对Delta和Omicron变体感染的保护效果。
“这种抗体的发现意味着我们在对抗COVID-19及其变种的过程中可以更加自信。在新加坡国立大学医学部和清华大学内部建立了强大的合作关系后，我们的科学家将能够改进我们的技术，以确定有可能治疗未来可能出现的更多未知变体的抗体，”新加坡国立大学医学部BSL-3核心设施科学和服务支持团队负责人Mok Chee Keng博士说。
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科学家首次在气溶胶内建立德尔塔新冠变种病毒模型
2021年5月，美国疾病控制中心(CDC)正式承认SARS-CoV-2--引起COVID-19的病毒--是空气传播的，这意味着它是通过空气高度传播的。现在，加州大学圣地亚哥分校化学和生物化学教授和捐赠主席Rommie Amaro跟美国各地和世界各地的合作伙伴一起首次在气溶胶内建立了德尔塔病毒的模型。
这项工作入围了戈登贝尔奖，该奖项由美国计算机协会每年颁发，以表彰高性能计算方面的杰出成就。Amaro领导的团队去年因对全原子SARS-CoV-2病毒和该病毒的刺突蛋白进行建模以了解其行为方式和进入人体细胞的方式而获得该奖项。
“连续第二年入围戈登贝尔奖，这真是太好了，”Amaro说道，“但不仅如此，我们对这项工作有可能加深我们对病毒如何通过气溶胶传播的理解感到非常兴奋。这些影响可能会改变我们看待空气传播疾病的方式。”
气溶胶是微小的。一根人类头发的直径约为100微米。飞沫--想想你打喷嚏时从你的嘴巴和鼻子里喷出来的飞沫--大于100微米，并在几秒钟内落到地上。相比之下，气溶胶--仅是通过呼吸和说话产生的--是所有小于100微米的东西，其可以在空气中漂浮数小时并进行远距离传播。
大气化学杰出主席、气溶胶对环境化学影响中心(CAICE)主任Kim Prather广泛地研究了海雾和海洋气溶胶。几年前，她跟Amaro取得联系，指出这些气溶胶中的含量远远超过了海水。
Prather说道：“过去通常的想法是，海洋气溶胶只包含盐水。但我们发现有大量的海洋生物在里面，包括蛋白质和病毒。我不仅认为Rommie会对研究这个感兴趣，而且认为她的工作可以真正有利于帮助我们更好地了解气溶胶的组成和运动以及空气中的生存。”
Amaro的实验室开始利用Prather在海雾方面的工作开发气溶胶外观的计算机模型。这些模拟为Amaro和她的小组了解一般用于研究气溶胶的实验方法和工具铺平了道路，另外还开发了一个有用的框架来建立、模拟和分析复杂的气溶胶模型。
当SARS-CoV-2在2020年初出现时，她开始对该病毒进行建模并能显示出它是如何通过一种叫做糖衣的糖衣覆盖刺突蛋白来感染宿主细胞的。
气溶胶科学家一直怀疑SARS-CoV-2是通过空气传播的，因此研究气溶胶中的病毒提供了一个用证据来支持这些怀疑的机会。通过利用实验室已经在做的气溶胶工作和实验室还在做的病毒工作，Amaro将二者结合了起来。
“正是这些细小的气溶胶可以走得最远并进入肺部深处，而这可能是毁灭性的，”Amaro说道，“没有任何实验工具，没有任何显微镜可以让人们看到如此详细的颗粒，但这种新的计算显微镜让我们看到病毒发生了什么--它如何移动，它如何在飞行中保持感染性。能够看到某样东西的样子，看到各部分是如何组合在一起的，这有一种非常强大的力量--它从根本上改变了人们甚至想到要问的各种问题。”
为了更好地了解病毒如何在气溶胶内移动和生存，Amaro跟来自全球各地的52个团队合作--包括橡树岭国家实验室--使用他们的Summit超级计算机来模拟模型。Summit是世界上少数能进行这些大规模模拟的超级计算机之一，它使研究人员能够看到前所未有的10亿个原子的气溶胶。
这些模拟包括病毒膜的更复杂的细节以及气溶胶的可视化。除了SARS-CoV-2病毒之外，这些亚微米级的呼吸道气溶胶还含有粘蛋白、肺表面活性剂、水和离子。
粘蛋白是一种聚合物，在包括呼吸道在内的人体大部分潮湿的表面上排列，它们可能能起到保护病毒免受阳光等恶劣的外部因素影响的作用。Amaro的团队正在探索的一个假设是SARS-CoV-2的德尔塔变体是否更具传播性，部分原因是它似乎跟粘液蛋白的互动如此之好。
现在模型已经建立，Amaro希望正式创建一个实验以测试气溶胶病毒运动的预测。另外，她还在开发工具以研究湿度、风和其他外部条件如何影响气溶胶中病毒的传播和寿命。
除了尽可能多地了解SARS-CoV-2是如何运作的迫切需求之外，气溶胶的计算机模型可以产生广泛的影响，其中包括气候科学和人类健康。
加州大学圣地亚哥分校医学院医学系教授Robert"Chip"Schooley博士表示：“我们在大流行期间了解到的是，气溶胶是传播病毒的主要动力之一，它们在许多其他呼吸道病原体传播中的重要性一直被系统地低估了。我们对气溶胶的了解越多以及它们如何承载病毒和污染物如烟尘、对健康有不利影响，我们就越有能力创造有效的治疗和缓解措施。这有利于全世界人民的公共健康和福祉。”
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免费COVID-19测试套件本周抵达美国家庭 但不能申领超过四次
1月13日，美国总统拜登就政府提供免费上门COVID-19测试的计划进行了更新，包括配套网站何时启动的时间表。拜登当时说，该网站有望在"下周"推出，指的是1月16日开始的那一周，看来这一估计是准确的。在线订购门户现在已经上线，尽管公众要到本周晚些时候才能够提交他们的订单。
用于在美国订购免费上门COVID-19测试的网站名为COVIDtests.gov，现在任何人都可以访问它。根据该网站目前的主页，访问者将能够从1月19日开始订购免费测试，不过这个机会将有一个硬性限制：每个家庭不能超过四次免费测试。
根据普遍的美国家庭规模，这可能已经足够对家里的每个人进行一次测试，但对于那些经常去看望年迈亲戚送杂货和处理家务的人来说，这并不是非常有用。尽管如此，有完全免费的在家测试选择是对政府提供的免费疫苗和其他大流行病相关服务的一个很好的补充。
该网站目前可以提供的内容非常有限，仅仅是介绍关于测试的关键细节的单一页面，以及该网站的一个西班牙语版本。政府在网页上指出，它不会向用户收取运费，也不会要求用户提供任何付款细节，如信用卡号码来下订单。
该订购门户将于1月19日启动，最初一批是5亿份COVID-19测试盒，即最初在2021年12月宣布的那些。拜登在上周的更新中说，白宫已经在努力获取另一批5亿个测试，最终使提供给公众的总数至少达到10亿个。
目前还不清楚额外的库存是否会导致每个家庭可以订购的测试数量的增加，这种变化可能会随着时间的推移根据需求而到来。免费测试计划是在一波几乎完全由关注Omicron的变种引起的COVID-19病例中提供的，Omicron的传染性远远高于以前的病毒版本。
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研究：长病程COVID患者在感染后8个月仍存在免疫失调
发表在《自然-免疫学》杂志上的一项全面的新研究报告称，长病程COVID患者在初次感染后八个月内仍存在免疫失调。澳大利亚的研究人员发现，长COVID的特点是特定的免疫生物标志物水平升高，为这种新兴的慢性疾病提供了迄今为止最有力的客观证据。然而，研究人员指出，目前仍不清楚接种疫苗或奥密克戎变异株对长COVID会产生什么影响。
该研究在急性SARS-CoV-2感染后对147人进行了8个月的系统跟踪。大约20%的患者在初次感染四个月后出现了长病程COVID症状。
在研究过程中，研究人员在几个点上对所有受试者进行了血样采集。研究人员对每个病人的免疫系统在COVID-19之后的几个月里的反应情况感兴趣。
“在进行这项研究时，我们正在寻找血清中的蛋白质，”这项新研究的共同牵头人Chansavath Phetsouphanh说。“这些蛋白质，或生物标志物，是一种疾病引起的异常过程的证据。我们分析了我们怀疑可能被COVID-19'触发'的31种不同的生物标志物，我们确定了与长病程COVID综合征有关的一小部分。”
与由未感染的受试者或感染其他冠状病毒的受试者组成的对照组相比，COVID-19患者的六种特定免疫生物标志物明显升高。在感染后四个月内，这些生物标志物的水平在长病程COVID病例和没有持续症状的COVID病例之间几乎没有区别。但是从四个月开始，这些升高的免疫生物标志物在非长病程COVID受试者中开始下降，而在长病程COVID患者中仍然很高。
特别是，研究注意到两种被称为干扰素的免疫细胞在8个月时在长病程COVID队列中与所有其他对照组相比仍然明显偏高。这种免疫功能紊乱的模式是如此明显，以至于研究人员仅仅通过研究血液样本中的免疫生物标志物就能有效地识别长病程COVID患者，准确率达80%。
“......我们发现I型和III型干扰素的水平持续升高--这是细胞为应对病毒的存在而制造的蛋白质类型，”Phetsouphanh解释说。“这些干扰素通常在感染痊愈后消失，但在患有长病程COVID患者中，我们发现它们在很长一段时间内都存在。”
Phetsouphanh还指出，这些持续的免疫学变化与初始感染的严重程度没有关系。虽然长病程COVID在急性疾病住院患者中的报告率很高，但10%到30%的轻度病例都有长病程COVID的迹象。
这项新研究是在2020年最初感染的未接种疫苗的受试者中进行的。因此，现阶段还不清楚奥密克戎等新变异株或两到三剂量的疫苗接种计划是否会显著影响这些免疫学长病程COVID特征。
“从一些早期的国际数据来看，我们非常希望在较温和的变异株和高接种率的情况下，我们可能会看到较少的长病程COVID病例，但我们需要进一步的免疫学数据才能确定这一点，”共同主要作者David Darley补充说。"我们目前正在研究德尔塔感染者的一些数据，以了解接种疫苗是否可能减少长病程COVID的可能性。"
雪松西奈医疗中心的研究人员最近的一项类似研究归纳了另一个免疫生物标志物，该标志物在长病程COVID患者中持续升高，直至最初感染后六个月。伦敦玛丽女王大学的研究员Deepti Gurdasani说目前还不清楚这种持续的免疫失调意味着什么，但她称这还是令人担忧。
“这是因为病毒的持续存在，还是病毒抗原，还是感染后的自身免疫，现在还不知道，”Gurdasani在Twitter上说。“它可能是其中之一，甚至是一种组合--但所有的可能性都应该引起我们的关注。”
在最近的一次采访中，斯克里普斯研究转化研究所的创始人Eric Topol讨论了围绕奥密克戎、疫苗接种和长病程COVID的不确定性。他说，由于奥密克戎的免疫逃避能力，长病程COVID有可能在这个奥密克戎感染人群中高度流行。而且，Topol指出，即使接种疫苗能将一个人患长病程COVID的几率减少一半，我们仍然可能面临一个巨大的问题，即让病毒席卷整个社区。
“现在我们应该对长病程COVID进行最坏的打算，”Topol说。“这种每天有数百万人感染的想法基本上忽略了长病程COVID的担忧。”
这项新研究的合著者Greg Dore在接受《悉尼先驱晨报》采访时说，未来几个月将是了解奥密克戎变异株造成的长病程COVID负担的关键。Dore认为奥密克戎的大规模传播性可能会导致相当程度的长病程COVID。
Dore说：“在奥密克戎感染的巨大浪潮中，即使有一个不太严重的变异株，其中一小部分长病程COVID患者可能会转化为相当大的疾病负担。我们将在未来三个月内知道更多关于奥密克戎对长病程COVID的影响。”
这项新研究发表在《自然-免疫学》上。
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科学家发现可能导致COVID新治疗方法的关键分子
许多针对COVID-19的治疗方法都集中在病毒用来与人体细胞结合的刺突蛋白上。虽然这些治疗方法对原始毒株很有效，但对未来的变异毒株可能不那么有效。芝加哥大学普利兹克分子工程学院的 Juan de Pablo 教授和他的小组利用先进的计算模拟来研究另一种蛋白质，这种蛋白质对病毒的复制至关重要，并且在不同的冠状病毒中保持相对一致。
这种蛋白质被称为Nsp13，属于一类被称为解旋酶的酶，它在病毒的复制过程中发挥着作用。
通过这项工作，科学家们还发现了三种能够与Nsp13结合并抑制病毒复制的不同化合物。鉴于不同冠状病毒变体的解旋酶序列的一致性，这些抑制剂可以作为设计针对解旋酶的药物以治疗COVID-19的宝贵起点。
de Pablo说：“我们目前只有一种治疗COVID-19的方法，而且随着病毒的变异，我们绝对需要针对除刺突蛋白之外的不同构件。我们的工作揭示了小分子如何能够调控病毒复制中一个有吸引力的目标的行为，并表明现有的分子‘支架’是COVID治疗的有希望的候选者。”
该成果发表在《科学进展》杂志上。
在过去的两年里，de Pablo和他的小组利用先进的计算模拟来研究使导致COVID-19的病毒复制或感染细胞的蛋白质。这些模拟需要用强大的算法进行数月的极其复杂的计算，最终揭示了该病毒在分子水平上是如何工作的。
在这个项目中，合作者研究了蛋白质Nsp13，它将双链DNA解开成两条单链--这是复制的一个关键步骤。此前，研究人员知道Nsp13进行这种解旋，但对这一过程的复杂动态没有很好的了解。模拟显示了该蛋白内的多个结构域是如何相互沟通并协同作用以施加正确的力量进行解旋的。
他们还发现，当外部分子与蛋白质的某些部位结合时，就会破坏这个“通信网络”。这意味着该蛋白不能再有效地解开DNA，病毒的复制变得更加困难。
一些化合物已经被报道为Nsp13抑制剂，但研究人员选择了三种化合物在其模拟中进行测试：Bananin、SSYA10-001和chromone-4c。
研究人员发现，这三种化合物似乎都能通过与某些位点结合并破坏蛋白质的网络而有效地破坏Nsp13蛋白质。现在，de Pablo和他的合作者正在与实验者合作，在实验室里测试他们的结果。
此前，该小组利用计算分析揭示了药物Ebselen是如何与病毒的主要蛋白酶，或MPro结合的。在一项不同的研究中，他们还揭示了抗病毒药物 瑞德西韦（Remdesivir）是如何与该病毒结合并进行干扰的。他们还展示了化合物木犀草素如何抑制病毒的复制能力。
研究人员甚至利用他们模拟的信息来设计一种治疗COVID-19的新药，他们希望在未来几个月内发表。
de Pablo说：“我们继续研究影响病毒不同部分、不同蛋白质的药物，然后用实验数据来确认其疗效。我们现在有一系列的候选药物，我们新设计的药物可能成为未来治疗COVID-19和新型冠状病毒的改变者。”
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科学家确定COVID-19再感染的免疫标记 防御危险新变种时至关重要
许多专家现在预测，随着SARS-CoV-2新的传染性变体的出现，迄今已在全世界造成550多万人死亡的COVID-19将继续流行。这些新的变种可能构成比以前的变种更大的再感染风险--感染已经感染过COVID-19的人。快速识别再感染病例和突发事件可以改善公共卫生反应，并可以尽快揭示逃避疫苗接种保护的变种。
本周发表在mBio上的一项研究，由来自Broad研究所、麻省理工学院、哈佛医学院和SpaceX公司的合作者提出了一种跟踪这些病例的方法。在这项工作中，一个多机构的研究小组已经确定了对应于重新感染和重新暴露于病毒的免疫学血液生物标志物。
从事这项研究的免疫学家、病毒学家、生物学家和其他人员指出："在自然和疫苗免疫力减弱的情况下，全球各地都出现了再感染，甚至在以前被感染和接种过疫苗的人中也是如此。"
以前的研究报告称，猕猴对SARS-CoV-2感染的临床反应与人类相似。在新的研究中，研究人员研究了一组以前感染过该病毒的猕猴。他们将这些灵长类动物暴露在不同剂量的病毒变体下，并在原始感染和重新挑战之前和之后收集血液样本。
值得注意的是，对血样的分析显示了再感染的不同生物标志物。其中包括免疫球蛋白抗体水平的增加，这些抗体与穗蛋白、核壳蛋白或病毒颗粒的其他部分结合。暴露于更高剂量的病毒的动物显示出更高的SARS-CoV-2免疫球蛋白反应。
作者报告说，这些免疫学特征区分了猕猴的原发感染和再次接触及再感染。研究人员随后分析了一小群人类的血液样本，这些人参加了SpaceX的一个社区监测队列，并被冠状病毒重新感染了。对人类的研究证实了此前对猕猴的研究结果。
作者指出，接下来可以借此研发简单、廉价和广泛使用的监测工具来确定新的感染热点。这项新工作显示了简单的滴度如何可以被用作随时可用的再感染标记。监测和控制感染和再感染的能力取决于开发简单的、免疫学上合理的筛选策略。
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