处理越级上报问题，要分三个管理层次、三种下属情况，因人而异、对症下药。
多年前，我就遇到了同样的苦恼。我空降半年后，一位业务骨干，经常越级向上级报告，比如说我交办的任务，他不向我汇报直接向上级领导汇报，好像无视我的存在，别的下属同事也冷眼旁观。
你说我在乎吧，显得没有胸怀；说我不在乎吧，搞得我没面子，让其他下属看笑话。
我心里明白，我空降抢了人家的位置，要容忍他的发泄。不可理喻的是，我们的上级居然纵容下属经常越级报告。我明白首先解决的问题不是下属，而是上级，不取得上级对我的绝对支持，警告下属，传出去就是打压下属能人。上级领导可能也不满我的空降，这可能是问题的根本。
下属越级汇报怎么办？傻瓜才找领导，高手用“3+3”策略赢主动。
我采取几个步骤。
一是取得关键上级的支持。我到派我来的大领导办公室，侧面反映了“空降兵”常见的烦恼，大领导一听就明白了。有一次，大领导请上级领导吃饭，把我也叫过去，让我多敬几杯酒。其实啥话也没聊，上级领导就明白了。
二是取得直接上级的支持。跟上级领导搞好关系，他安排的事情尽心尽力去做，消除他对我的陌生感和排外情绪。
三是合理手段鼓励刺头。我继续正常与那位骨干下属交往，他越级汇报就汇报吧，他的工作表面上支持，实际上不格外增加资源，让他自己蹦跶，团结其他同事，把其他的同事工作量安排饱满，让他们没有精力去支持那位下属的工作。
四是发挥上级维护秩序的作用。我取得上级领导支持后，这位下属再越级上报的时候，领导对他说，这件事你直接向部门经理汇报，不用再向我报告了。重复两三次之后，这位下属就彻底死心了。我该怎么用他就怎么用，与以前没什么不同，再说了，不用白不同。从此，这个问题解决了。后来，听别人说，我们上级领导还评价我，这小子挺成熟的，还算是正面评价吧。
回到题主这个具体问题上来，再从理论上谈几点看法：
下属“偶尔”越级上报，作为直接领导，应该保持一定胸怀，不提倡，但不禁止。下属偶尔越级上报，也有管理的两面性，你可以利用这种“不正规”行为，琢磨其他的有用信息，比如，让下属去“试错”，比如，反利用，判断上级领导的准确意图。过于在意下属越级汇报，反映你不够自信，产生嫉妒、吃味、不舒服、担心等心理，虽然很正常，但也是一种自我修炼。
但是，必须转折一下：下属“不断”越级上报，这是违反职业精神、破坏职场规则的严重问题。遇到这样问题，你一定要解决，否则，对团队建设破坏力巨大。但，你也不一定非要着急解决。要找到这种职场“反常”问题的根源，首先是上级领导有问题，其次是你驾驭力有问题，再次才是思考如何制服下属的具体策略。
作为上级，对职场认识应该更深一层，应该明白下管一级的责权利对等原则，只要上级说一句话，“这样的事情你向主管上司汇报就可以了”，替中层维护好职场秩序，这个问题就迎刃而解了。上级喜欢或支持这种越级汇报，尽管不是优秀的管理行为，但可能有多种因素，所以，解决这个问题，要因人而异、对症下药。
第一，取得上级领导的支持，是解决这个问题的根本。
上级领导这么纵容或者喜欢下属越级汇报，一是有上级领导管理偏好问题，二是对你也不太满意甚至不太信任的因素，三是你不是上级领导直接提拔的嫡系，对你不太感冒，四是故意给你难堪，让你服服帖帖，警告你随时可以架空你。对你这样的中层，首先要搞好与上级的管理，取得他对你的信任和支持。动用的其他手段也有多种，比如，可以请可靠的领导帮忙沟通，加强与上级领导走动，等等，总之，要取得上级领导的支持。只要上级领导对越级下属说，这样的问题找你们部门经理汇报就行了，既堵住了越级上报的口子，也表明上级对你的力挺，让你处理以来有底气。
第二，在取得上级支持的前提下，优先策略是，把坏事变成好事。
越级上报的下属，一般有三种：一种是不懂眼神、不懂规则的职场破坏者，想起来就到领导屋里说几句，有时候还沾沾自喜，在同事面前邀功，“你看我胆子大不大，我才不在乎什么狗屁规则呢”。一种是心怀鬼胎的小人下属，总想表现自己，给上级打小报告、上眼药，甚至传递你的内幕，目的是搞掉你。一种是不服你的骨干下属，不认可你的安排，不同意你的思路，瞧不起你的做事风格，看不起你的领导才华，越级汇报，既是表现自己，也是故意跟你做对，我就是不服你怎么啦！
对不懂事的下属，要利用；对小人下属，要打压。对能干的下属，优先策略是，通过努力，争取转化成你的支持力量。这类人，有想法有干劲想干事，如果能为你所用，助你如虎添翼，正所谓“不打不成交”。如果跟你做对，消耗你的资源，甚至破坏你的工作布局。对于这种人，可能是顺毛驴，捋顺了就是你的干将，捋不顺就是你的肉中刺。
第三，如果转化不过来，就要打压加利用，下下策，是让他滚蛋。
有越级汇报的下属，你就不能容忍，说明你胸怀还不够宽广，自信度不够。几个苍蝇嗡嗡叫，你还不干活了？你职位越高，遇到了复杂问题越多，处理起来更复杂，这点小事处理不了，你还能堪当重任吗？
一是对不懂事的下属，不鼓励，不禁止，随他去。故意把一些不成熟的风透给他，利用他去探听上级和同事的反映，来修正你的决策。几个这样的下属，伤害不了什么。
二是对背后打小报告的小人下属，绵里藏针，警告加敲打。比如，微笑地说，你向上级反映的事，上级找我谈话了，有啥事当面说，帮助我改正，好不好？这一句话有三层意思，一是上级挺你，二是别做小人行径，有事当面说，三是帮助我改正，还给他留着后路。小人下属，改正就好，继续使用他干活。不改正，找个机会，让他出局。
三是对能干的下属，要么转化，要么让其滚蛋。这样的下属就是不服你，故意越过你汇报。首先还是宽容以待，争取转化为自己的得力干将。这是对你是否有高超领导力的考验。坦诚交流，充分授权，给他干事舞台，提供资源支持，经常表扬，给予奖励，公平公正。必要时，进行感情投资。古代将军，都把能投降的敌人用好，何况只是不服气的下属呢？实在转化不了，下下策，让他另谋高就。
怎么制伏不服气的下属呢？
首先要团结其他下属，不要形成群体对抗，让大多数下属支持你。其次要公平公正地打击，不要让群体对你产生打击报复的印象。再次就是让不服气的人使劲折腾，你合理布局，不让他从事核心业务，不让其他同事提供支援，你不给额外的资源，他啥事也干不成，还抓不住你把柄。要么服气，要么走人。
总结：越高的层次，越级汇报的事情越少，越级汇报，多出现在中低层。作为中低层的管理者，要处理好胸怀和手腕的辩证关系。你要想成长为高层管理者，在中低层管理岗位上的磨炼是不可少的，处理这类棘手问题，不要单一思维，不要单一措施，既要展现你的管理手腕，也要展示你的容忍胸怀，毕竟站在高层看你处理行为，高层是从手段和胸怀两个维度去考量你的，绝对不是仅仅看你的招数。
高层管理者。可以称作“领导者”，关键作用是战略眼光和识人用人。选好助手和中层，是他的领导力体现，一般不会选择那些不懂职场规矩的人。
中层管理者。关键作用是驾驭团队完成任务，既要用管理手腕去治理团队成员，也要体现出成长为高层管理者的综合素养。中层管理人员中，只有少量人，体现出具备优秀高层管理者的潜力。这个潜力，必须包括用好每一种人的胸怀。
基层管理者。实际就是一个小工头，自己亲自干，带领下属干，下属不干的，你自己也要顶上干，总之是以完成任务为考核指标。对基层管理者的要求是比较低层次，就是要求你无论用什么手段，把活儿干漂亮就行。谈情怀、胸怀、境界，还没到那个层次。
最后的建议。如何处理越级上报的下属，你处于什么管理层级，就要用什么手段。你为来长期发展，可以把处理这些事情，当作领导力修炼的一种实践，怀着更高的追求，用最合理的手段去做，难道不是一种“既解决现实问题，又进行领导力磨炼”的实践吗？